Nature:科学家构建基因表达调控DNA序列进化和适应度景观研究框架
顺式作用元件是位于基因旁侧序列中能影响基因表达的非编码DNA序列。这些顺式作用元件的突变可能影响与基因转录因子相互作用，从而调控基因表达，进而改变生物表型和适应度景观。一个完整的适应度景观由一个适应度函数定义，该函数将序列空间中的每个序列映射到其相关的适应度。但调控DNA序列与适应度建立的映射关系很难可靠地推广到整个序列空间，因此构建完全的适应度
Nature Machine Intelligence：发现基于Transformer的多肽-HLA I类结合预测和疫苗的新生抗原序列设计
近日，国际知名期刊《Nature Machine Intelligence》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院魏冬青团队的研究论文《A transformer-based model to predict peptide–HLA class I binding and optimize mutated peptides for v
Nature Genetics：科学家揭示人类基因调控元件的序列决定因素
DNA可以决定基因表达的位置和时间，但控制基因表达的全套序列决定因素仍不清楚。近日，芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了题为“Sequence determinants of human gene regulatory elements”的文章。研究人员使用大规模平行报告试验测量了比人类基因组大100倍
Science：王立平团队等发现大脑序列信息编码的“降维”策略
无论语言沟通、执行动作还是情景记忆，本质上都涉及大脑对时序信息的表征（信息在头脑中的呈现方式）。序列信息编码被认为是人类语言句法结构的前提，对机器学习领域产生重大影响，但对其编码机制人们却知之甚少。中科院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）研究员王立平团队、上海脑科学与类脑研究中心副研究员闵斌和北京大学生命科学学院教授唐世明
Science：中国科学家团队揭示序列工作记忆在猕猴大脑中表征的几何结构
《Science》期刊以长文形式发表了题为《序列工作记忆在猕猴前额叶表征的几何结构》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、中国科学院灵长类神经生物学重点实验室王立平研究组、上海脑科学与类脑研究中心闵斌副研究员和北京大学生命科学学院唐世明课题组合作完成。在该研究中，科学家训练猕猴记忆由多个空间位置组成的序列，并利用在体双
The Journal of Neuroscience：王立平团队评估发展和演化对于序列学习和记忆的影响
近日，The Journal of Neuroscience以封面文章形式在线发表了题为《空间序列的工作记忆：对于顺序和关系结构编码的发育和演化因素》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、上海脑科学与类脑研究中心、中科院灵长类神经生物学重点实验室王立平研究组完成。该研究通过行为学分析和建模发现，
揭示DNA结合蛋白高效结合DNA靶序列的新机制
2022年1月28日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自瑞典乌普萨拉大学的研究人员展示了DNA结合蛋白如何在不受到阻碍的情况下在整个基因组中搜索它的靶序列。这一结果与我们目前对基因调控的理解------遗传密码影响DNA结合蛋白的结合频率，但不影响它的结合时间---相矛盾。相关研究结果发表在2022年1月28日的Science期刊上，论文标题为
英国病毒学家：看起来像是序列被污染了...
塞浦路斯科学家宣布在当地社区发现了一种新的新冠病毒变异毒株，该毒株为德尔塔与奥密克戎的重组体。随后，塞浦路斯共和国卫生部长Michalis Hadjipantelas表示：“我们为本国科学家的这一发现感到骄傲。”塞浦路斯国家新冠疫情科学咨询委员会成员、塞浦路斯大学生物技术与分子病毒学实验室主任Leontios Kostrikis博士表示，在当地社
科研人员开发出分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics
生物体的核酸与蛋白质分子的序列组分及相关特征（如GC/AG含量、密码子使用偏好、蛋白质物理化学性质等）对于研究基因功能和物种演化具有重要意义，是理解不同物种、不同基因家族以及不同功能基因之间差异的数据基础。近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics正式上线，旨在对序列
Molecular Cancer: 颅咽管瘤中CTNNB1新突变的全基因组序列分析
颅咽管瘤(CP)是一种罕见的组织学良性肿瘤，但因其与中枢神经系统的重要结构密切相关，临床上极具挑战性。CP可分为两大亚型：造釉细胞型CP(ACP)和乳头型CP(PCP)。