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Evol Bioinfor:于军等重复序列与哺乳动物基因组内含子扩张关系研究获进展

近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Evolutionary Bioinformatics杂志发表。

2012-11-18

PLoS One:中国广州EBV相关胃癌LMP2A序列变化研究

潜伏膜蛋白2A (LMP2A),表达于大多数人类疱疹病毒(EBV)有关的恶性肿瘤,已经被证明是潜伏性感染及上皮细胞转化的主要诱因。 除此以外,它也可以作为基于CTL(cytotoxic T lymphocyte,细胞毒性T淋巴细胞)治疗EBV关联的恶性肿瘤的靶点。

2012-11-18

Science:单细胞测序显示:同一个人的不同神经元DNA序列不一样

2013年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --之前大家一直认为一个人体内的每个细胞都有相同的遗传信息,基因组的特殊表达模式使得不同细胞的功能各异。然而最近发表在Science杂志上的文章推翻了该观点。 确定一个人的不同神经元的基因组只能采用单细胞基因组测序的方法。索尔克研究所的科学家采用单细胞基因组测序的方法发现同一个人中不同的神经元基因组存在多样性。

2013-11-05

Nature:最早马的基因组序列被确定

一个低覆盖率的基因组序列草图已从在加拿大育空地区一处永久冻土地点挖掘出的一件马骨获得,时间在距今大约560,000 至780,000年前。这是迄今所确定的最早的基因组序列。研究人员将这些数据与一匹“晚更新世”马的基因组序列草图、五个现代家马品种的基因组序列草图、一匹Przewalski马和一头驴的基因组序列草图进行了对比。

2013-07-06

Veter Res:大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化

大鲵 (或称娃娃鱼) 是世界上现存最大的濒危珍稀两栖动物,为我国所特有、被列为国家二级保护野生动物。虹彩病毒在全球范围普遍流行,是侵染众多鱼类、两栖类及爬行类等水生动物的重要病毒病原。有证据表明,虹彩病毒是包括蛙和大鲵在内的两栖类自然种群显著下降或消亡的原因之一,而鉴定虹彩病毒病原并阐明其基因组结构特征是研发相应病害防控技术的前提。

2013-10-24

Nat Methods:蛋白序列比对新工具HHblits更快更准

近日,来自德国慕尼黑大学的研究人员在Nature Methods杂志上发表论文"HHblits: lightning-fast iterative protein sequence searching by HMM-HMM alignment"介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits,这是一种能极大增加蛋白功能性分析技术的软件,能通过新颖的序列寻找方法...

2012-11-18

Methods:德发明蛋白序列比对新工具——HHblits

近日,德国慕尼黑大学的研究人员发表论文介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits。相关成果公布在《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上。

2012-11-18

谷峰:PAM序列可影响CRISPR/Cas9介导的基因组编辑效率

2014年9月26日讯/生物谷BIOON/--9月26日,由生物谷主办的2014基因组编辑研讨会在上海好望角大饭店隆重举行。温州医科大学附属眼视光医院的谷峰教授参加了此次大会并发表了题为"PAM序列对CRISPR/Cas9介导的基因组编辑

2014-09-28

MCB:发现非编码序列调控基因表达的拼图

来自瑞典卡罗琳斯卡医学院的研究人员取得了基因调控研究的突破性进展——他们识别出了结合在调控基因表达的400多个蛋白上的DNA序列,这将有助于解析为什么不同的个体基因组对疾病患病风险的影响不同。 2000年,科学家们完成了人类基因组测序,希望能将这整个人类DNA序列信息,迅速转换到临床应用上来,比如新型药物,和能判断有患病风险的个体的预测工具。

2013-02-01

Cell Reports:复合物Msh2-Msh3干扰冈崎片段加工来促进三核苷酸重复序列扩增

2012年9月3日 讯 /生物谷BIOON/ --科学家们假设DNA复制错误会导致三核苷酸重复(trinucleotide repeat, TNR)序列扩增,特别是在DNA滞后链的复制过程中。如果滞后链能够成功复制的话,那么就需要对冈崎片段进行加工,并将它们连接到连续链(continuous strand)上。

2012-11-18