Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
Nature:揭示导致人类非洲昏睡病的布氏锥虫战胜宿主免疫反应的新机制
结果表明,布氏锥虫将组织作为相对受保护的空间,可以在其中存活更长时间,产生更多样的VSG变体,并有可能以比免疫系统更快的速度将这些变体重新传播到血液中。
2024-11-21
Cell | 揭秘纤毛内运输的奥秘:逆向纤毛内运输的分子结构新发现
该研究通过结合Cryo-ET和XL-MS技术,首次详细解析了逆向IFT列车的三维结构。揭示了逆向IFT列车的组装机制和蛋白质重排过程,为理解纤毛内双向运输的调控机制提供了新的视角。
2024-08-05
Science:新研究鉴定出一组让有益细菌植物乳杆菌在宿主肠道中成功定植的基因
这些作者开发了一种技术,使他们能够实时观察植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)的单个细胞在果蝇肠道内的壁龛(niche)定植。
2025-01-05
EMBO Rep | 综述:程功团队总结病毒通过操控宿主行为来促进传播的分子策略
该综述总结了病毒通过操控宿主层面的行为互作或调控细胞层面的胞间传播,促进其传播的复杂分子策略,为理解病毒传播动态及制定干预策略提供了新的见解。
2024-08-04