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研究揭示APA调控宿主天然抗病毒免疫新机制

本研究中,课题组对APA加工过程中关键的加工蛋白进行筛选,发现核心3’末端加工因子CPSF6在病毒感染后蛋白表达显著降低,是病毒感染期间宿主细胞全局3’UTR缩短的重要原因。

2024-04-22

Cell | 隐翅虫“生化武器”进化的基因组学与细胞基础

研究人员通过基因组组装、比较基因组学、进化树构建、细胞特异性转录组学等方法对隐翅虫的防御性腺体的分泌特征以及进化特征进行了刻画,并对隐翅虫与蚁类共生体这一高复杂性的分泌特征进行检测。

2024-07-18

CGM:我国科学家探究TP53基因缺失如何驱动胃癌进化

随着胃癌病情的发展,特定基因的改变,包括基因拷贝数的变化和结构变异,会以相对明确但并非随机的顺序发生,这对癌症充分发挥其恶性潜能至关重要。

2024-05-20

《Gastric Cancer》揭示幽门螺杆菌通过TLR6通路诱导宿主免疫耐受机制

幽门螺杆菌是最早被发现能在人类胃内寄生的微生物,已感染了超过50%的人类。Hp与胃炎和胃癌等疾病密切相关,被世界卫生组织定为一类致癌物。

2024-07-17

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Nat Eco Evo | 吴法柏/Bernheim团队揭示从古菌到真核的免疫蛋白进化

Viperin(干扰素诱导内质网关联病毒抑制蛋白)是人类先天免疫系统的成员,直接参与到病毒防御中。

2024-07-16

Nature:揭示导致人类非洲昏睡病的布氏锥虫战胜宿主免疫反应的新机制

结果表明,布氏锥虫将组织作为相对受保护的空间,可以在其中存活更长时间,产生更多样的VSG变体,并有可能以比免疫系统更快的速度将这些变体重新传播到血液中。

2024-11-21

Nature 子刊:结核分枝杆菌利用自身的丙氨酸脱氢酶抑制宿主免疫

抗菌肽(AMPs)是一种古老的细菌清除剂,在结核分枝杆菌感染的巨噬细胞中诱导作用很差,但其潜在机制尚不清楚。

2024-05-25

二球悬铃木古六倍体基因组进化及开花调节方面取得重要进展

研究结果表明二球悬铃木开花时间基因的拷贝数增加及随后的亚功能化/新功能化可能为二球悬铃木独特的开花特征提供了遗传基础。

2024-06-13