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利用SpG和SpRY变体极大拓展水稻基因组编辑范围

  近日,中国水稻研究所王克剑团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋团队合作,在Science China Life Sciences在线发表了题为 Expanding the scope of genome editing with SpGand SpRY variants in rice的研究论文。该研究发现,SpG变体在水稻中

2021-01-14

Science:利用基因组流行病学准确追踪英国COVID-19传播链

2021年1月15日讯/生物谷BIOON/---根据研究人员对英国第一波COVID-19大流行的5万多个病毒序列的分析,SARS-CoV-2病毒在2020年初被引入英国的次数远远超过1000次。英国在2020年3月全国封锁前引入的病毒谱系往往规模更大,地理分布更分散。传染病流行是由传播链构成的,然而人们但对于共同传播谱系(co-circulating tra

2021-01-15

研究开发出一种人工基因组的高效简化策略

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院研究员戴俊彪团队开发出一种被称为SGC(SCRaMbLE-based genome compaction)的人工基因组的高效简化策略,并以此方法删除了第十二号染色体左臂中超过一半的非必需基因,为第一个最小真核基因组的构建、理解真核生命的核心组成奠定了理论和技术基础。相关研究成果以Compacting

2021-01-11

基因组测序揭示番石榴维生素C合成和果实软化遗传基础

   番石榴(Psidium guajava)是桃金娘科的重要果树,主要产于美洲和亚洲热带及亚热带地区。它因适应性强、容易栽培,产量高,且富含维生素C(抗坏血酸)等营养物质而广受欢迎,被誉为“热带苹果”。番石榴果实是重要的天然维生素C来源,但其维生素C合成的遗传基础却少有研究。桃金娘科是植物果实类型演化研究的重要模式,兼有肉质的

2021-01-14

Nature:基因组中串联重复序列的突变或在自闭症谱系障碍发生中扮演关键角色

2021年1月18日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究发现,名为串联重复序列(tandem repeats)的特定DNA区域所发生的突变或在自闭症谱系障碍(ASD)发生过程中扮演关键角色;本文研究揭示了这种并不起眼的突变或许也会与自闭症发生风险直接相关。研究者Meli

2021-01-17

科学家开发出了一种能直接揭示细胞内基因组序列和结构的新技术!

2021年1月20日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇刊登在国际杂志Science上题为“In situ genome sequencing resolves DNA sequence and structure in intact biological samples”的研究报告中,来自博德研究所等机构的科学家们通过研究将DNA测序从测序仪中“提取

2021-01-19

研究揭示同源转座子维持普通小麦多倍体亚基因组高级结构稳定性

  Genome Biology在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧研究组与河南农业大学、中国农业科学院和河南科技学院合作完成的题为Homology-mediated inter-chromosomal interactions in hexaploid wheat lead to specific subgenome ter

2021-01-14

Science子刊:我国科学家基于全基因组筛选鉴定出促进细胞衰老的基因KAT7

2021年1月8日讯/生物谷BIOON/---理解细胞衰老的遗传学和表观遗传学基础对于开发减缓衰老的干预措施至关重要。虽然已知细胞衰老会促进老化,但控制这一过程的许多机制仍然知之甚少。在一项新的研究中,来自中国科学院、中国科学院大学、北京大学和首都医科大学宣武医院的研究人员使用两种类型的表现出加速衰老的人间充质前体细胞(hMPC)进行了基于CRISPR-Ca

2021-01-08

研究揭示乙肝病毒DNA与人基因组互作景观图

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是全球性重大公共卫生健康问题之一,目前,全球乙肝病毒慢性感染者人数较多。HBV属嗜肝DNA病毒科,在人体肝脏细胞核内可形成cccDNA、整合入人体基因组等病毒DNA形式稳定存在,这是HBV维持长期慢性感染的关键。因此,研究乙肝病毒与宿主基因组相互作用特征具有重要意义。近期,中国科学院生物物理研究所

2021-01-01

中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法,并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组

   三代测序技术(PacBio和Oxford Nanopore)可解决基因组重复区域的组装难题,提高基因组完整性,已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中,纳米孔(Nanopore)测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低,并且由于其可实现超长读长(高达1Mbp),在复杂基因组组装中具有天然优势。然

2021-01-15