两篇Science论文揭示人黏连蛋白通过挤压DNA环进行基因组组装
2019年12月21日讯/生物谷BIOON/---黏连蛋白(cohesin)是一种结合染色体的多亚基腺苷三磷酸酶复合物。在加载到染色体上后,它会产生DNA环来调节染色体功能。有人提出黏连蛋白通过环挤压来实现基因组组装,然而缺乏直接的证据来支持这一点。在第一项新的研究中,奥地利维也纳生物中心分子病理学研究所(IMP)主任Jan-Michael Peters及其
研究人员开发高质量基因组组装软件
11月25日,中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组开发的高质量基因组组装软件HERA在《自然-通讯》在线发表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。论文题目为Assembly of chromosome-scale contigs by efficiently resolving
Nat Cell Biol:靶向抑制关键基因突变有望彻底根治结肠癌
2019年11月8日 讯 /生物谷BIOON/ --在近乎90%结肠癌病例中,患者机体的肿瘤细胞都会携带APC基因突变,其或能作为一种新型靶点来帮助开发广谱有效的结肠癌治疗手段;日前,来自德国维尔茨堡大学等机构的科学家们就通过研究来寻找癌细胞中的特殊靶点,以此来帮助开发摧毁结肠癌细胞的新型疗法,相关研究刊登在国际杂志Nature Cell Biology上。图片来源:Armin Wiegering
核酸自组装纳米结构的肿瘤靶向治疗方面获进展
化疗是治疗癌症的主要手段之一,顺铂和卡铂等铂类化合物作为一线化疗药物被广泛应用于癌症的临床治疗。铂类药物的抗肿瘤活性主要基于其与DNA的共价或非共价作用,这类相互作用是没有细胞选择性的,因而在利用铂药进行化疗的过程中会出现严重的毒副作用,包括肾毒性、耳毒性和神经毒性等。发展新的铂药给药策略以提高疗效并降低毒副作用的研究一直以来都广受关注。自组装的DNA纳米结构具备优异的生物相容性,并且能够在肿瘤区
Nat Commun:乳腺癌基因有望成为开发肝母细胞瘤靶向性疗法的潜在靶点
2019年9月11日 讯 /生物谷BIOON/ --肝母细胞瘤(hepatoblastoma)是一种罕见的肝癌,其发病率仅为百万分之几,然而其却是引发婴儿和幼儿患肝癌的主要原因,大部分的患者往往会在三岁之前确诊为这类癌症。尽管手术和化疗研究的进展意味着肝母细胞瘤患者的预后总体上表现较好,但侵袭性肝母细胞瘤往往会让患者失去几乎所有治疗选择,同时患者长期的生存率也较低。图片来源:commons.wik
世界首个野生梨基因组图谱组装成功
8月1日,国际植物学领域权威期刊《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)在线发表世界首个野生梨高质量基因组图谱。该研究成果由中国农业科学院果树研究所研究员曹玉芬团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜团队等合作完成。科研人员以山西杜梨为材料,结合PacBio三代测序、Bionano光学图谱、Hi-C技术,组装了高质量的杜梨参考基因组序列,
Nat Biotechnol:开发出混合宏基因组装配器OPERA-MS,更准确地组装复杂的微生物群落
2019年8月6日讯/生物谷BIOON/---通过高通量宏基因组测序已实现了对微生物组的表征。然而,现有方法并不是将来自短读取技术和长读取技术的读取片段结合在一起。在一项新的研究中,来自新加坡国立大学、新加坡基因组研究院、新加坡陈笃生医院、南洋理工大学和克罗地亚萨格勒布大学的研究人员开发出一种称为OPERA-MS的混合宏基因组装配器,它将基于装配的宏基因组聚类与重复识别的精确支架结合在一起,以准确
Nat Commun:发现神经母细胞瘤癌基因,将助力靶向新药开发
2019年8月5日讯 /生物谷BIOON /——神经母细胞瘤占儿童癌症死亡总数的15%。高危神经母细胞瘤患者的生存率为50%。澳大利亚儿童癌症研究所的研究人员首次发现,一种名为JMJD6的基因在最具侵袭性的癌症中扮演着重要角色。这项研究于近日发表在《Nature Communications》杂志上。这一发现为治疗神经母细胞瘤开辟了一条新途径。图片来源:Nature Communications众