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Cell Res:首个知识与数据联合驱动的多物种生命基础大模型GeneCompass,解析基因调控密码,打造干湿融合新范式

研究人员开发的GeneCompass模型参数量超过1.3亿,是国际上首个融入先验知识的预训练基础大模型,探索了知识与数据联合驱动的新范式。

2024-10-12

Clin Mol Hepatol:DNA甲基组分析揭示了晚期代谢功能障碍相关脂肪变性肝病补体基因的表观遗传改变

本研究首次揭示了在代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展过程中肝脏补体基因的表观遗传和转录变化,这些发现对于理解MASLD进展的核心机制和开发靶向治疗方法具有潜在的意义。

2024-08-31

Cell:科学家识别出与乳腺癌和卵巢癌发生相关的数千种新型基因突变

研究者表示,这项研究结果表明,乳腺癌和卵巢癌的遗传风险并不是一个简单的“是”或“否”的情况,而是存在于基于遗传改变如何影响蛋白质功能的范围内。

2024-10-04

Cell:新研究成功构建出模拟 tau 蛋白聚集物扩散的人类神经元模型

为了阻止tau传播,Gan团队采用CRISPRi筛选技术让一千个基因失活,以确定它们在tau传播中的作用。他们发现了500个对tau丰度有重大影响的基因。

2024-04-24

Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

研究发现一氧化氮互作蛋白调控低糖诱导神经元凋亡的新机制

该研究开发的NOP-1是双功能活性的探针,能够对细胞中的NO进行实时成像并共价标记临近蛋白,独特的设计将瞬时细胞NO信号转换为永久性荧光染色,与免疫染色和多重成像兼容。

2024-05-24

Nature Methods:蛋白质相互作用的全新探索——高分辨率交联质谱(XL-MS)标准的建立与应用前景

交联质谱(Cross-Linking Mass Spectrometry, XL-MS)因其可以提供高分辨率的结构信息,在蛋白质相互作用研究中发挥了重要作用。

2024-11-12

J Extracell Vesicles:碱性休克蛋白(Asp23)控制的细胞壁失衡促进了金黄色葡萄球菌的膜泡生物发生

在本研究中,研究者证明了替代sigma因子B中的Q225P替代通过阻碍SigB与asp23启动子的特异性结合,从而抑制碱性休克蛋白23 (Asp23)的表达,触发金黄色葡萄球菌菌株MV产生。

2024-10-26

Nature子刊:上海科技大学水雯箐/庄敏团队解析内源GLP-1受体的细胞膜蛋白互作组

该研究不仅为内源GLP-1R的细胞膜蛋白互作组解析提供了一种新型的化学生物学技术,也为深入理解其细胞类型特异的功能调控机制奠定了基础。

2024-09-05

发现恢复RAS突变蛋白分解GTP能力的三复合体抑制剂,有望开出新的癌症治疗药物

本研究证实某些抑制剂让由促进癌症生长的RAS基因突变引起的信号传递失控发生短路。

2024-11-19