PNAS：科学家利用机器学习算法来识别人类基因组中的古老RNA病毒片段！
2021年2月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一篇发表在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中，来自日本多个研究机构的科学家们通过研究，成功利用机器学习算法来从人类基因组中识别古老的RNA病毒残留物，文章中，研究人员描述了他们如何教授AI系统来识别RNA病毒残留并利用其在
科研人员完成染色体水平青虾全基因组图谱拼装
日前，中国水产科学研究院淡水渔业研究中心傅洪拓研究员团队与华大海洋研究院石琼研究员团队合作，完成了染色体水平青虾基因组图谱拼装，该项工作是青虾和虾蟹类基因组研究的重要突破。研究团队依托江苏省水产三新工程“基于全基因组测序的青虾种质资源和功能基因挖掘（D2015-16）”等项目的资助，对青虾进行全基因组测序和拼装。由于青虾基因组约为4.
研究发布新的非编码RNA整合资源NONCODEV6数据库
长非编码RNA（long non-coding RNAs）是一类长度大于200 nt的非编码RNA。已有研究表明，长非编码RNA具有重要的调控功能，在植物和动物的生物学过程中发挥重要作用。此外，lncRNA还与人类一些疾病的发生发展密切相关。因此，对lncRNA的注释、探索lncRNA的功能具有重要意义。近年来，一些研究集中于lncRNA功能的探
云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
从20世纪70年代开始，云南省怒江州就开始种植草果，到2020年，种植面积已达111万亩，不仅是全国草果的核心产区，也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。为了加快提高草果遗传改良效率，培育高产、抗病、优质、安全新品种，对从源头创新保障草果产业健康可持续发展，2019年9月，怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构，正式启动草果全基
利用SpG和SpRY变体极大拓展水稻基因组编辑范围
近日，中国水稻研究所王克剑团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋团队合作，在Science China Life Sciences在线发表了题为 Expanding the scope of genome editing with SpGand SpRY variants in rice的研究论文。该研究发现，SpG变体在水稻中
Science：利用基因组流行病学准确追踪英国COVID-19传播链
2021年1月15日讯/生物谷BIOON/---根据研究人员对英国第一波COVID-19大流行的5万多个病毒序列的分析，SARS-CoV-2病毒在2020年初被引入英国的次数远远超过1000次。英国在2020年3月全国封锁前引入的病毒谱系往往规模更大，地理分布更分散。传染病流行是由传播链构成的，然而人们但对于共同传播谱系（co-circulating tra
研究开发出一种人工基因组的高效简化策略
近日，中国科学院深圳先进技术研究院研究员戴俊彪团队开发出一种被称为SGC（SCRaMbLE-based genome compaction）的人工基因组的高效简化策略，并以此方法删除了第十二号染色体左臂中超过一半的非必需基因，为第一个最小真核基因组的构建、理解真核生命的核心组成奠定了理论和技术基础。相关研究成果以Compacting
全基因组测序揭示番石榴维生素C合成和果实软化遗传基础
番石榴（Psidium guajava）是桃金娘科的重要果树，主要产于美洲和亚洲热带及亚热带地区。它因适应性强、容易栽培，产量高，且富含维生素C（抗坏血酸）等营养物质而广受欢迎，被誉为“热带苹果”。番石榴果实是重要的天然维生素C来源，但其维生素C合成的遗传基础却少有研究。桃金娘科是植物果实类型演化研究的重要模式，兼有肉质的
中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法，并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组
三代测序技术（PacBio和Oxford Nanopore）可解决基因组重复区域的组装难题，提高基因组完整性，已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中，纳米孔（Nanopore）测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低，并且由于其可实现超长读长（高达1Mbp），在复杂基因组组装中具有天然优势。然
研究开发出基于宏基因组的亚胺还原酶工具箱
生物催化尤其是酶促不对称还原胺化合成手性胺，为许多高值化合物的高效绿色合成提供了有效途径。然而，新酶发现仍是酶促不对称合成过程中具有挑战和限速的步骤。寻找更快、更简捷的新酶筛选方法，引起了越来越多的关注。中国科学院天津工业生物技术研究所研究员朱敦明、吴洽庆带领的生物催化与绿色化工团队，与英国曼彻斯特大学教授Nicholas