Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3
总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。
宏基因组揭示煤矿来源酸性废水的抗性组特征研究中获进展
研究发现,污染土壤和背景土壤均具有多药抗性机制占主导地位的抗生素抗性组,这或归因于多药抗性机制相关基因具有抗酸、抗金属等功能。研究进一步发现,AMD污染降低了土壤中ARGs的相对丰度
基于基因组靶向挖掘发现真菌黄酮生物合成新机制获得进展
该研究完整剖析了真菌黄酮独特的生物合成途径,提示了真菌黄酮合成途径在进化上是独立的而非通过基因水平转移从植物中获得。这丰富了自然界黄酮生物合成的多样性,为黄酮的合成生物技术开发与微生物高效制造提供
Cell Discovery:发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等,在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。
黄海所、华大等机构发布迄今最大动物基因组参考序列
在磷虾基因组里鉴定得到的25个显著扩张的基因家族中,分别有6个基因家族与磷虾蜕壳及能量代谢相关。其中,具有代表性的蜕壳和能量代谢相关基因在冬、夏季显著差异的表达水平,与之前有关南极磷虾越冬策略和相关生
中国农业大学:MDM2拮抗剂可以促进CRISPR/Cas9介导的精确基因组编辑
聚集的规则间隔短回文重复序列/CRISPR相关蛋白9核酸酶(CRISPR-Cas9)系统成为一种强大的工具,可以对真核生物基因组进行有针对性和有效的修饰。
光遗传学眼科基因治疗明星初创公司宣布关停,临床前数据未达预期
Cyrus Mozayeni 表示,这些数据对于公司的科学来说是非常有希望的迹象。不仅提高了公司主导项目成功的可能性,而且还提高了建立管线和制备和生产高质量载体的能力。
Nature:剑桥大学徐宇/Michael Inouye构建出直接从基因型预测多组学数据的独特资源
在一项新的研究中,英国剑桥大学公共卫生与初级保健系的Yu Xu和Michael Inouye领导的一个国际研究小组构建了一种直接从基因型预测多组学数据的独特资源:OmicsPred。
Nature子刊:研究揭示三维基因组的单分子拓扑结构多样性和细胞异质性
高等真核生物基因组存在复杂的三维空间结构,在不同尺度下形成如染色质环(Chromatin loops)、拓扑关联结构域(TADs)、活性/非活性染色质区室(A/B compartments)和染色体域