Nature：利用单细胞谱系图谱追踪细胞直接重编程
2018年12月13日/生物谷BIOON/---直接细胞谱系重编程涉及细胞身份转换，比如Fábio F. Rosa等人近期发现让小鼠成纤维细胞表达三种转录因子PU.1、IRF8和BATF3就可直接将它们重编程为呈递抗原的树突细胞，此外，让人类成纤维细胞表达这三种转录因子也可实现这一点（Science Immunology, 07 Dec 2018, doi:10.1126/sciimmunol.a
Neuron：新研究揭示线虫的基因表达完整图谱
2018年12月12日 讯 /生物谷BIOON/ --你的大脑是如何“建造”出来的？神经元定位以及功能的实现需要遵循怎样的“规则”呢，它们如何相互连接以及它们执行哪些功能？“创建这个极其复杂的大脑神经网络是需要基因编码完成的。”Cell Miller教授，David Miller博士说: “如果你真的想了解如何大脑是如何建造出来的，那么你需要了解首先了解其遗传学机制。”Miller和他在范德堡大学
研究解析人类大脑纺锤形神经元的转录图谱
人类大脑的认知功能如语言、思维和情感等赋予了人类非凡的感知力、智慧和创造力。研究发现，在旧大陆猴、猿类和人类等灵长类的大脑中进化出了一类新的神经细胞，称为von Economo neuron (VEN)，又称spindle neuron（纺锤形神经元），但这类神经元在新大陆猴等更原始的灵长类中没有。人类大脑中的VEN数量是最多的，但仅集中分布于前脑岛和前扣带回两个脑区。有鉴于VEN的巨大双极神经元
Sci Rep:表观遗传学图谱帮助治疗听力丧失
2018年12月5日 讯 /生物谷BIOON/ --表观遗传学负责研究基因的表达和控制过程。内耳中的表观遗传学修饰是揭示听觉发生的关键。由特拉维夫大学萨克勒医学院副院长Karen B. Avraham教授领导的研究小组现已创建了第一张内耳的“甲基化”图谱，侧面反映了遍观遗传调控的机制。Avraham教授与TAU博士生Ofer Yizhar-Barnea和R. David Hawkins教授以及华盛
Cell：构建出人类免疫细胞图谱，可确定遗传变异对基因表达的影响
2018年11月18日/生物谷BIOON/---比较任何两个人的DNA，你会发现他们的遗传密码中的数百万个位点存在着不同。如今，在一项新的研究中，来自美国拉霍亚免疫学研究所（LJI）的研究人员分享了大量数据，这些数据对于破译这种自然遗传变异如何影响免疫系统保护我们健康的能力至关重要。相关研究结果于2018年11月15日在线发表在Cell期刊上，论文标题为“Impact of Genetic Pol
Nature：构建出首个人类早期妊娠细胞图谱，揭示母体免疫系统在早期妊娠发生的变化
2018年11月17日/生物谷BIOON/---维持健康的妊娠有时是困难的：许多妇女遭受流产或死产，而其他妇女出现先兆子痫等问题。许多这些问题的根源发生在妊娠的最初几周，这也是胎盘形成的时候。胎儿着床到母体中称为蜕膜（decidua）的子宫内膜上，从而为胎盘提供良好的血液供应。研究母体和胎儿之间的界面可能有助于解答许多重要问题，包括母体的免疫系统如何发生变化从而允许母体和发育中的胎儿共同存在。 然
Science：著名华人学者庄小威再发力作，构建出下丘脑视前区的细胞空间图谱
2018年11月6日/生物谷BIOON/---科学家们早就意识到为了研究大脑，就必须了解组成大脑的细胞。如果获取一块大脑组织，研究组织中细胞表达的基因，这可发现大脑组织中存在多少种细胞类型，但是这仍然会留下一大大问题：为了研究这些细胞表达的基因，需要将它们从大脑组织中脱离下来，然而，这会丢失宝贵的信息---它们是如何在组织中组装在一起的。因此，如果人们想要真正地理解大脑，就需要了解大脑中的细胞所在
人类原发性癌症染色质可接近性图谱揭示DNA-蛋白结合与癌症发生存在着关联
2018年10月27日/生物谷BIOON/---癌症是世界范围内死亡的主要原因之一。尽管2％的编码蛋白的人类基因组已被广泛研究，但是关于癌症中的非编码基因组（占人类基因组的98%）和基因调控，仍然有很多是未知的。通过转录因子（transcription factor, TF）作用于分散在非编码基因组中的发挥着长程影响的DNA调节元件，基因在适当的细胞类型和细胞状态中打开和关闭。癌症基因组图谱（Th
模式硅藻的蛋白质组精细图谱完成
硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物，分布广泛，提供了地球上约20%的初级生产力，对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因组序列于2008年公布，但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)是利用蛋白质组学数据，尤其是高精度的串联质谱数据，结合基因组和转录组
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1，001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs， lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27，341对lncRNA-药物可预关联（lncRNA-drug predictiv