Nature子刊:西湖大学杨剑团队绘制迄今最全RNA可变剪接遗传调控图谱
为什么有的人对疾病易感,而有的人不易感?答案藏在每个人的基因组里,因为我们的基因组存在差异;那么,这些差异发生在基因组的哪些位点,又对应了人体的哪些生老病死?
NAR:人类基因组可变剪切变异一网打尽——SPCards新手使用指南
Pre-mRNA剪接在维持人类蛋白质多样性和复杂的生物功能中发挥着不可或缺的作用。超过90%的人类基因通过选择性剪接产生多个成熟mRNA,参与组织或细胞特异性生物过程。
Science Advances:癌症中发现全新的长度依赖性的异常剪接调控模式
在机制研究上,该研究提出了两种影响CASE剪接的机制。癌症中癌细胞快速地生长增殖需要更快的转录过程,因此癌症中异常的转录或对剪接产生影响。
王泽峰团队发现癌症中广泛存在一种全新的长度依赖性剪接失调
该研究共鉴定出了494个癌症相关的短外显子(cancer-associated short exons, CASE)并进行了进一步的深入研究。研究团队利用CASE的剪接开发了一个用于癌症预测的随机森林
Cell Report: SRSF3调节lncRNA ANRIL剪接促进胰腺癌对吉西他滨的耐药性
胰腺癌是全球癌症相关死亡的第七大常见原因,总体5年存活率为9%。先前的一项研究预测,到2030年,胰腺癌可能成为癌症相关死亡的第二大常见原因。
Molecular Therapy: Nucleic Acids 【选择性剪接】PHF5A通过TEAD2选择性剪接促进大肠癌进展
选择性剪接(AS)是转录后基因调控的普遍机制之一。这一过程能够从单个基因产生多个RNA转录本,并使蛋白质组多样化。
Cancer Res: 基于ASO的PKM剪接切换治疗抑制肝癌生长
M2丙酮酸激酶(PKM2)亚型在大多数癌症中表达上调,并在Warburg效应的调节中起着关键作用,Warburg效应的特点是能量代谢更倾向于有氧糖酵解而不是氧化磷酸化。PKM2是PKM基因的选择性剪接异构体,是潜在的治疗靶点。
Blood Cancer Discov:急性淋巴细胞白血病中的异常RNA剪接事件导致免疫治疗抵抗性
在一项新的研究中,来自美国费城儿童医院的研究人员发现编码表面抗原CD22的mRNA的异常剪接导致儿童B淋巴细胞白血病(B-ALL)中这种蛋白的下调,使恶性肿瘤细胞对靶向CD22的免疫疗法的效果产生抵抗性。这些发现可能让肿瘤学家对新患者进行筛查,看他们的白血病细胞是否含有选择性剪接的CD22 mRNA变体,从而揭示哪些患者可能对抗CD22疗法没有反应而需要其他的治疗方案。
DRAK2 通过与 SRSF6 相关的 RNA 选择性剪接加剧非酒精性脂肪肝疾病的进展
非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是一种晚期非酒精性脂肪性肝病(NAFLD),其后果严重,目前缺乏批准的药物治疗。