Science子刊：我国科学家开发出针对ctDNA甲基化特征的机器学习算法来诊断结直肠癌
在一项新的研究中，来自中国中山大学肿瘤防治中心、广州优泽生物技术有限公司、华中科技大学同济医学院、上海市第一人民医院、四川大学、第四军医大学和澳门科技大学的研究人员使用了一种针对癌症甲基化特征的机器学习算法来诊断结直肠癌。
多篇研究成果聚焦甲基化研究领域新进展！
本文中，小编整理了多篇重要研究成果，共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展，分享给大家！图片来源：Vossman/ Wikipedia【1】Nature：母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生doi：10.1038/s41586-019-1536-1发育通常被认为是在基因组中固定下来的，不过有几项证据表明它易受环境调节的影响，可能产生长期后果
群体水平揭示玉米DNA甲基化变异对表型的贡献
DNA甲基化对植物的生长发育和环境响应起着十分重要的作用。作为一种较为稳定的遗传信息，DNA甲基化既可由DNA序列变异诱发，也可独立于DNA序列产生纯表观遗传变异，这种独立的程度和DNA甲基化对基因表达以及表型变异的影响一直是研究热点。近日，华中农业大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中的DNA甲基化变异，揭示了DNA甲基化变异的遗传基础以及DNA甲基化变异与基因表达和表型的关
植物DNA去甲基化的机理和功能
10月19日，Journal of Integrative Plant Biology（JIPB）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation in plants 的综述论文。这篇文章概述了最新的植物中DNA去甲基化的调控机理，以及其在模式植物和作物
研究发现m6A RNA甲基化识别蛋白YTHDF1在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中的重要功能
10月25日，《自然-通讯》（Nature Communications）以YTHDF1 links hypoxia adaptation and non-small cell lung cancer progression 为题，在线发表了中国科学院昆明动物研究所陈勇彬学科组的最新研究成果。该研究揭示了YTHDF1在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中的重要功能和分子调控机理。陈勇彬学科
研究揭示RNA甲基化调控R-loop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA：DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构，在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能，包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等，但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高的修饰类型，广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化以及肿瘤生成和转移
科研人员研发RNA甲基化7-甲基鸟嘌呤测序技术
7-甲基鸟嘌呤（m7G）修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一，广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区，对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰，然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队开发了单碱基分辨率的m7G高通量测序技术(m7G miCLIP-seq)，通过
Nature：母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生
2019年9月19日讯/生物谷BIOON/---发育通常被认为是在基因组中固定下来的，不过有几项证据表明它易受环境调节的影响，可能产生长期后果。胚胎生殖系由于具有代际表观遗传效应的潜力而受到特别关注。哺乳动物生殖系经历广泛的DNA去甲基化，这在很大程度上通过连续细胞分裂对甲基化进行被动稀释而发生，并且伴随着TET酶对活性DNA的去甲基化。人们已发现TET酶活性受到诸如维生素C之类的营养物和代谢物的
研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰，而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能，在疾病、发育过程中所扮演的具体角色，以及控制基因表达的详细机理，直到今天并没有全面详细的认知。2019年8月15日，美国Whitehead研究所Rudolf Jaenisch联合其他课题组在Molecular Cell上发表文章Dynamic Enhancer
Nature：揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DNA甲基化
2019年9月18日讯/生物谷BIOON/---催化DNA中CpG甲基化的酶，包括DNA甲基转移酶1（DNMT1）、DNA甲基转移酶3A（DNMT3A）和DNA甲基转移酶3B（DNMT3B）。这些DNA甲基转移酶对于哺乳动物组织发育和体内平衡是必不可少的。它们还与人类发育障碍和癌症有关，这就支持DNA甲基化在细胞命运的指定和维持中起着关键作用。之前的研究已表明组蛋白的翻译后修饰参与了确定启动子和活