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Cell Genomics:刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录跨模态整合分析的AI框架——UniTCR

UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架,以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。

2024-05-06

Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

首次绘制出酵母基因编码蛋白在完整细胞周期中的精密运动与分布图谱

酵母作为真核生物的理想模型,其独特优势在于能够让我们观测到大规模的生物学过程,这是在其他更简单或更复杂的生物体中难以实现的。通过研究酵母细胞周期,有望深化对人类细胞周期机制的理解。

2024-05-02

空间学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测

研究者在此基础上进一步优化革新,发展了uCoTargetX技术,在国际上率先实现单细胞多种组蛋白修饰和转录组的并行检测,为深入研究各种生理病理状态下细胞命运的表观调控提供了强有力的技术工具。

2024-01-16

Sci Transl Med:科学家绘制出人类足月分娩期间机体胎盘组织的单细胞图谱

研究人员通过利用单细胞RNA测序(也称为单细胞转录组学)创建了胎盘图谱,该图谱能分析单一细胞的活性和型号模式。

2024-01-23

Nat Methods | 单细胞三维基因与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程

该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。

2024-04-17

J Dent Res:新研究成功绘制牙髓干细胞和牙周膜干细胞的基因图谱

在一项新的研究中,来自美国牙医协会福赛斯研究所(ADA Forsyth Institute)和北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员利用单细胞转录组分析,成功绘制了牙髓干细胞(dental pulp st

2024-01-17

研究建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制

发育过程中,我们四肢的形成并非一蹴而就,而是经历过复杂的细胞演变过程。在胚胎发育第四周末,四肢仅以简单的几乎均一细胞团形状凸起出现在身体的两侧,但到了第八周,这一细胞团则已经完全分化,形成具有复杂解剖

2023-12-16

Nature:利用新开发的Slide-tags技术在单细胞分辨率上构建组织内细胞遗传活动的空间模式图谱

当科学家们想要在分子水平上研究心脏或大脑等器官内的单个细胞时,他们通常会将组织打碎来分析细胞。这提供了有关基因活性的丰富细节,但无法保留细胞在组织中的位置信息。

2023-12-26