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Genome Biol:新研究构建出单细胞多组学人类细胞百科全书

这种新的单细胞图谱(SCA)是基于对来自125种不同成人和胎儿组织的数千份人体组织样本的分析。

2024-05-23

Cell系列综述:刘光慧团队在单细胞水平上概述代谢衰老的异质性

该综述详尽地概述了代谢衰老在组织和细胞异质性上的特征,并分析了这些异质性对干预措施的反应。同时深入剖析了衰老过程中关键代谢途径的脆弱性,并评估了在不同器官和细胞类型中代谢衰老干预策略的效能。

2024-10-07

Journal of Advanced Research: 转录关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路

研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。

2024-07-30

Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法

结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。

2024-10-02

Nature Genetics:单细胞视角下的肿瘤增殖密码——SPRINTER精准解析克隆异质性的新工具

该方法不仅揭示了克隆间增殖率的显著异质性,还关联了高增殖克隆与癌症转移潜力、循环肿瘤DNA(ctDNA)释放等临床重要特征。

2024-12-08

Nature:单细胞多组学研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因

这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。

2024-10-03

Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性

利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。

2024-10-03

空间学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

科研人员解析单细胞投射谱助力内源性镇痛作用神经环路机制

杏仁中央核(CEA)是疼痛和情绪调控的重要节点。该脑区以抑制性神经元为主,且密集表达MOR,这提示CEA可能是内源性阿片类物质镇痛的关键靶点。

2024-06-19

Science:利用人工智能确定人类基因转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26