Protein Cell:我国科学家首次构建出灵长类动物海马体衰老的单核转录组图
在我们的大脑深处有一个叫做海马体的区域。它在学习和记忆中起着至关重要的作用,它随着年龄的增长而逐渐退化,在功能上与各种人类神经退行性疾病有关。但是,是什么促使它走上衰老之路?海马体具有复杂的结构,由高度异质性的细胞组成,所以用传统的技术很难准确地揭示参与衰老过程的各种细胞类型的分子调节网络。此外,由于伦理方面的限
Nature Communications:GapClust方法能够高效准确地从大量单细胞转录组中发现稀有细胞群体
近日,国际知名期刊《Nature Communications》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院俞章盛团队的研究成果“GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profi
Nat Commun:恶性疟原虫转录与感染红细胞循环时间相关
恶性疟原虫是疟疾的主要病原体,它通过连续的无性红细胞内发育周期(IDCs)引发疾病,每个周期持续~48小时,产生8-30个新寄生虫。
Science:利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合,可能会在哺乳动物胚胎发育过程中,通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象:一个受精
Genes & Devel:科学家揭示如何阻断癌细胞的转录?
2021年7月27日 讯 /生物谷BIOON/ --阐明介导子如何与TFIID串扰促进启动子-增强子之间的交流沟通对于揭示增强子功能的机制非常重要;近日,一篇发表在国际杂志Genes & Development上题为“The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding
Genome Biology:开发出单细胞基因组单分子测序新方法
单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALB
Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维
Journal of Genetics and Genomics:单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱
水稻作为重要的粮食作物,为全球一半以上的人口提供主粮;同时,水稻作为单子叶模式植物,其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源,为理解植物发育的转录调控
Nat Immunol:两种转录因子或能互相合作抑制肿瘤浸润性CAR-T细胞的耗竭 有望改善多种癌症的治疗
2021年7月27日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子—活化T细胞核因子(NFAT,nuclear factor of activated T cells)和激活蛋白1(AP-1)能互相合作来促进T细胞的效应功能,但NFAT在AP-1缺失时会施加一种T细胞低反应性(耗竭)的负反馈程序。与肿瘤的斗争似乎是一场马拉松,而不是短跑,对于抗癌T细胞而言,比赛的
Nature发文:转录开关调控心脏成纤维细胞活化
越来越多研究表明,在许多人类疾病中,基因表达的动态变化助长了进行性的器官功能障碍。靶向基因转录已成为包括心力衰竭在内的各种慢性病的新治疗策略,其中BET蛋白的小分子抑制剂已经成为在体内可逆性的干扰增强子-启动子信号的有效工具,使用BET抑制剂可改善小鼠模型的心力衰竭,但具体机制尚不明确。近日,美国格莱斯顿研究所Deepak Sriva