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Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录新技术

MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。

2024-09-13

Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位

该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。

2025-02-26

Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间转录测序技术

在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。

2024-10-04

单细胞空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Nature Methods:Chip-Tip技术——突破单细胞蛋白质学研究瓶颈的革命性进展

这项研究不仅推动了单细胞蛋白质组学的技术发展,也为生物医学研究中细胞功能和疾病机制的深入理解奠定了基础。

2025-01-23

Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

Nature:西湖大学郭天南综述基于质谱的蛋白学——从单细胞到临床应用

该综述全面概述了蛋白组学的现状及其彻底改变生物学认知和变革医学实践的潜力。

2025-03-03

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因异源多倍化与生物钙化机制

针对仙掌藻和脆叉节藻的钙化模式的差异,该研究揭示了仙掌藻胞外钙化和脆叉节藻次级细胞壁钙化的遗传调控特征。

2024-10-04

Nat Methods:scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因复杂区域的染色质修饰

该研究开发了一种基于单分子测序平台的 scNanoSeq-CUT&Tag 新方法,可以精准检测单个细胞内染色质修饰特征,包括组蛋白修饰和转录因子的结合分布模式。

2024-10-12

Cancer Cell封面论文:林东昕/吴晨/常江/王晓群等绘制全球首个食管癌发生发展的单细胞多阶段空间进化图谱

研究突破传统肿瘤线性演化理论的局限,创新性地提出“癌变空间演化”理论框架,首次揭示了肿瘤相关成纤维细胞(CAF)与侵袭性上皮细胞在癌前病变阶段就可形成关键交互生态位的的肿瘤演化新机制。

2025-03-13