科学家开发一种新型微生物群体单细胞分辨率高通量空间转录组分析技术
近日，美国加州理工学院研究团队开发了一种新的高通量空间转录组成像方法——并行连续荧光原位杂交par-seqFISH（parallel sequential fluorescence in situ hybridization）技术，能够在单细胞水平鉴定和观察微生物基因表达谱和微尺度环境中的空间信息，同时利用成像系统对不同菌落核仁长度、
Gastroenterology:研究通过单细胞基因组测序揭示肝细胞癌的双相拷贝数演化模型
胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中，研究人
Genome Biology：开发出单细胞基因组单分子测序新方法
单细胞全基因组测序技术（scWGS）可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性，并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化，例如拷贝数变异（CNV）和点突变（单核苷酸变异，SNV）等。过去十年，研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术，例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术（MDA）、多重退火和基于环的扩增循环技术（MALB
Science：利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合，可能会在哺乳动物胚胎发育过程中，通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象：一个受精
Nature Communications：RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础
RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段，解析了许多RNA三维结构，揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展，研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术，并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中，揭示出RNA结
单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现取得进展
肿瘤微环境具有高度异质性，深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征，对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来，单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器，在相关研究中取得了一系列突破进展，包括揭示肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化关系以及这些免疫细胞在不同肿瘤免疫治疗中的潜在功能。近日，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、
Nature 子刊：单细胞测序揭秘治疗白血病的新方法
急性髓细胞性白血病（AML）是一类起源于白血病干细胞(LSC)的恶性克隆性疾病，但由于癌症干细胞的丰度低且与健康的造血干细胞（HSC）具有高度相似性而难以分离，因此阻碍了国际上针对靶向人体恶性细胞同时保留正常细胞的精密治疗方法的研究。
Nature：单细胞测序法为根治白血病开辟新途径
急性髓细胞性白血病（AML）是一类起源于白血病干细胞(LSC)的恶性克隆性疾病，但由于癌症干细胞的丰度低且与健康的造血干细胞（HSC）具有高度相似性而难以分离，因此阻碍了国际上针对靶向人体恶性细胞同时保留正常细胞的精密治疗方法的研究。近日，西班牙基因组调控中心（CRG）和欧洲分子生物学实验室（EMBL）的研究人员在《Nature Co
新型单细胞技术揭示免疫检查点调节新机制
免疫检查点分子是调节免疫应答激活与抑制平衡的关键分子。在正常生理状态下，抑制性免疫检查点在自身耐受和自身免疫防御中发挥重要作用，但在肿瘤患者中，抑制性免疫检查点表达上调，导致免疫逃逸。例如，抑制性免疫检查点CD274（也称为PD-L1）与T细胞上的程序性细胞死亡（PD）-1受体相互作用以抑制T细胞活化，在许多癌症中过表达。目前，通过阻