Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理
通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。
2024-09-26
单细胞RNA测序,揭示不同血管化策略对大脑类器官的影响
血管化的大脑类器官不太可能发生细胞死亡,因此被认为是未来大脑研究的标准。这项研究对于未来血管化类器官的制造至关重要,有望开发出更高保真的血管化类器官。
2023-12-22
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿
LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。
2024-06-12
Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析
本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。
2024-06-20
Cancer Cell:单细胞测序确定胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点
该研究对24个化疗前后的肿瘤组织进行了单细胞RNA测序,分析了神经母细胞瘤中的免疫调节相互作用,以确定优化免疫治疗效果的策略。
2024-01-15
Cell:小核仁RNA:调控细胞衰老的幕后推手
这项研究通过全基因组筛选,发现了一种保守的snoRNA:SNORA13,它是人类细胞和小鼠衰老所必需的,SNORA13能够负调控核糖体生物合成,直接与RPL23相互作用从而促进p53激活和细胞衰老。
2024-08-23