Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
《细胞·干细胞》:神经元APOE4与小胶质细胞在阿尔茨海默病中「协同作案」!
APOE4神经元显著增加了小鼠的Aβ和p-tau沉积,在没有早发性AD突变的小鼠中,小胶质细胞耗竭减少了移植了人APOE4神经元的小鼠的Aβ和p-tau沉积。
2024-11-13
Cancer Res:靶向YAP活性和谷氨酰胺代谢通过阻止细胞外基质积累协同抑制肿瘤进展
本研究结果表明,抑制谷氨酰胺的可用性通过降低cAMP/ pka依赖性LATS磷酸化导致癌细胞中YAP的激活,从而通过与邻近成纤维细胞的相互作用促进ECM沉积。
2024-08-24
Cell | 隐翅虫“生化武器”进化的基因组学与细胞基础
研究人员通过基因组组装、比较基因组学、进化树构建、细胞特异性转录组学等方法对隐翅虫的防御性腺体的分泌特征以及进化特征进行了刻画,并对隐翅虫与蚁类共生体这一高复杂性的分泌特征进行检测。
2024-07-18
J Nanobiotechnology:大肠杆菌介导的多功能纳米颗粒可与聚焦超声消融手术和化疗协同有效治疗肿瘤
本研究通过结合产气工程菌GVs-E成功开发出一种新型生物靶向增效剂,即PEI-PLGA/ EPI/PFH@ Fe3O4多功能载药NPs的大肠杆菌。
2024-10-26
Science:恶性疟原虫体外系统进化揭示了这种疟原虫产生耐药性的关键决定因素
作者分析了在实验室中进化出的724种恶性疟原虫的基因组,这些恶性疟原虫对118种不同的抗疟疾化合物具有耐药性,其中既包括已有的药物,也包括新的实验药物。
2024-12-05