QB期刊 |RNA-seq数据计算方法大汇总
引言 分子生物学的中心法则自1958年由Francis Crick提出到今年正好60周年,它描述了“DNA制造RNA,RNA制造蛋白质”的遗传信息的标准流程 [1]。十年前,第二代RNA测序技术(RNA-seq)的诞生及其迅速发展使得研究者可以在对RNA序列没有任何先验信息的情况下高通量地对全转录组进行测序 [2]。现如今第二
解密2018年诺贝尔化学奖之蛋白酶
在生物工程界,有一位魔术师,叫酶工程。它的魔力体现在凡是有生命的地方就有魔术师在那里活动,无论是花草树木还是鸟兽鱼虫,无论是高等的还是低等的,动植物都需要酶来维持生命。人类更是须臾不可离酶,新陈代谢过程的各种阶段,都需"望'酶'止渴"。加酶洗衣粉洗衣粉、多酶片等是酶工程在日常生活中应用的实例,而对于整个酶工程来说,这仅是酶工程大海之沧海之一粟,只是简单的应用而已,2018诺贝尔化学奖因
2018年诺贝尔化学奖揭晓!
2018年10月3日 讯 /生物谷BIOON/ --北京时间10月3日下午17:30,2018年诺贝尔化学奖揭晓,来自美国加州理工学院的研究者弗朗西丝·阿诺德(Frances H. Arnoid)、美国密苏里大学的研究者乔治·史密斯(George P. Smith)和英国剑桥大学的研究者格雷戈里·温特(Sir Gregory P. Winter)共同获得此奖;其中弗朗西丝·阿诺德因研究酶的定向进化
2018年诺贝尔化学奖深度解读!
2018年10月3日 讯 /生物谷BIOON/ --北京时间10月3日下午17:30,2018年诺贝尔化学奖揭晓,来自美国加州理工学院的研究者弗朗西丝-阿诺德(Frances H. Arnoid)、美国密苏里大学的研究者乔治-史密斯(George P. Smith)和英国剑桥大学的研究者格雷戈里-温特(Sir Gregory P. Winter)共同获得此奖;其中弗朗西丝-阿诺德因研究酶的定向进化
生物谷专访-中科院分离分析化学重点实验室 叶明亮研究员
编者按: 蛋白质修饰通常是增加一定的官能团到蛋白质中,修饰结果对调控蛋白质活性状态、折叠、稳定性、空间构象和配体结合具有至关重要的作用。常见的蛋白质翻译后修饰过程有磷酸化、乙酰化、泛素化、糖基化和甲基化等, 它们使蛋白质的结构更为复杂多样, 遗传调控更为精确精细,功能更为完善,作用更为专一。此外,治疗用蛋白质药物代谢动力学特性的优化、药效的提高也可以通过多种方式的化学修饰来实
四名华人学者入选生物技术领域“顶尖转化学者”榜单
近日,知名学术期刊《Nature Biotechnology》评选出了2017年度20位在生物技术领域的“顶尖转化学者”(top translational researchers),我们很高兴地看到有四位华人学者光荣入选。他们的研究推动了基因疗法、细胞疗法、药物递送、以及医疗诊断等新兴领域的快速发展。高光坪马萨诸塞大学/宾夕法尼亚大学高光坪教授课题组的主要研究方向是腺相关
Management Science:新计算方法可提高肾移植成功率
2018年9月6日 讯 /生物谷BIOON/ --终末肾功能衰竭的患者需要经常透析或新捐献的肾脏才能存活。供体肾脏的来源可以是尸体或找到自愿以及兼容的活体捐赠者(通常是家庭成员)。然后,进行医学和心理学测试以确定该供体是否确实是相容的。如果测试确定,例如,供体的肾脏不太可能被患者的身体接受,则该过程停止并重新开始寻找新的供体。(图片来源:www.pixabay.com)最近的一项创新是出现了一种称
Nat Commun: 先进计算方法加速药物靶向治疗的开发
2018年9月4日 讯 /生物谷BIOON/ --伦敦帝国理工学院,新加坡杜克国立大学医学院和比利时制药公司UCB合作发现了一种新的抗癫痫药物靶点和一种全新的方法,有望加速衰弱性疾病,如癫痫,的治疗与药物开发。作者等人合作开发了一种先进的计算方法来预测新的药物靶点。作为概念性验证,研究人员将他们的计算方法应用于癫痫的靶点与药物发现研究。临床前模型测试结果验证了该靶点的有效性以及药物阻断后的抗癫痫效
Sci Rep:计算机模拟能够预测疟疾的最新表型
2018年9月3日 讯 /生物谷BIOON/ --根据由“la Caixa”基金会支持的ISGlobal领导的一项研究,作者们发现了一类比世界卫生组织(WHO)定义的更严重的疟疾临床表型。结果表明,心力衰竭可能是疾病的致病机制,这对这些患者的临床管理会产生影响。尽管过去几十年取得了一定进展,但根据估计,2016年疟疾仍旧会造成近50万人死亡,其中大部分是儿童。确定严重疟疾的定义是为了确定那些有死亡
PLoS ONE:科学家找到计算轴突降解的新方法
2018年8月30日讯 /生物谷BIOON /——在哺乳动物神经系统发育过程中轴突会自然降解,但是在成年人神经退行性疾病中,相同的基因编码的细胞器调节异常则会破坏关键的结构。图片来源:PLOS ONE背根神经节(DRG)释放轴突神经生长因子(Nerve growth factor,NGF)是一个成熟的体外研究发育退化的生化和细胞生物学研究的实验模型。但是目前还缺乏可以准确测量轴突的降解的方法。为此