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纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论

 大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa

2020-11-19

研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型

  单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及

2020-11-12

新冠疫苗首个三期临床中期分析效果突出

 今天BioNTech /辉瑞公布了其新冠病毒感染mRNA疫苗BNT162b2三期临床的一个中期分析结果。这个三期临床招募43,538 位志愿者、分别使用两针该疫苗和安慰剂,原计划总两组共32人感染时进行第一个中期分析、但后来扩大到62人, 最后分析需要等164人感染。今天这个分析是根据第二针疫苗7天后(第一针28天后)94位感染患者的数据,结果显

2020-11-10

香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队:纳米孔全基因组测序分析发现全球首例COVID-19康复患者二次感染

 8月,香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队利用纳米孔手持便携式测序仪MinION进行全基因组测序,结合ARTIC和Medaka工作流程分析,发现全球首例COVID-19康复者二次感染病例,基因组学分析显示两次感染病毒不同。对两次感染的病毒基因组学进行分析发现首次感染的病毒基因组属于GISAID V分支、Nextstain19A分

2020-11-17

香港理工大学副教授Gilman Kit Hang Siu 研究团队:纳米孔测序分析香港第三波疫情或由外地输入

 7月初起,中国香港特区出现第三波新冠病毒大规模传播。7月底,香港文汇报、轻新闻、icable TV、now TV等多家媒体报道:香港理工大学副教授Gilman Kit Hang Siu(萧杰恒)研究团队基于纳米孔测序技术,对26名病人病毒样本进行SARS-CoV-2溯源研究,发现确诊感染者体内的病毒株属同类(“G型病毒株”的变种“GR型病毒株”)

2020-11-17

Science:从结构上分析候选新冠疫苗NVAX-CoV2373中的全长刺突蛋白

2020年11月7日讯/生物谷BIOON/---严重急性呼吸道综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)于2002-2003年在全球爆发。与SARS-CoV同属β冠状病毒(β-CoV)属的SARS-CoV-2在2019年底出现,传播迅速,到2020年9月全球感染人数超过2800万。由SARS-CoV-2引起的2019年冠状病毒病(COVID-19)被世界

2020-11-07

Cancer Cell:大规模的癌症蛋白质组分析揭示癌细胞对药物疗法产生反应后的蛋白质特性改变

2020年11月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Cancer Cell上的研究报告中,来自德克萨斯大学MD安德森癌症研究中心等机构的科学家们通过对癌细胞系在药物疗法中所产生的蛋白质改变进行大规模的特性分析,有望帮助预测癌细胞对药物的敏感性,以及理解癌细胞的耐药机制并识别出最佳的疗法策略组合。研究者表示,当进行了包括168种不同化

2020-11-11

英国国家卫生研究院发布报告

 连续三周卧床不起,经历了呼吸困难、头痛、结膜炎、喉咙痛、身体疼痛等一系列症状。连续两个月失去味觉,无论冷热咸甜,都难以分辨,也闻不出任何味道。直到四个月后,还持续疲劳,也无法长时间集中注意力……“压力不断堆积,看不到希望。”作为一名医生,也是一名新冠感染长期症状的经历者,Monica Maltas博士在《柳叶刀》旗下期刊EClinicalMedi

2020-10-22

Mol Cell:新方法或能帮助分析细胞功能及其累积的突变 有望改善白血病等多种类型癌症的研究

2020年11月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自瑞典卡罗琳学院等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法,其能够联合分析细胞的状态以及单一细胞中积累的遗传突变,这种方法或有望用于儿童白血病和其它癌症的研究。图片来源:Wikipedia研究者表示,这种方法能帮助他们研究这些遗传突变如何改

2020-11-04

华西医院大规模分析:打破传统,做肠镜前无需只吃流食

肠镜是结直肠癌筛查最常用的有效工具,也常用于多种下消化道疾病的诊疗。做肠镜前,通常需要进行肠道准备,包括饮食限制以及药物清肠,从而提高肠镜检查的有效性和安全性。但是,这个过程非常考验患者的意愿度和依从性。比如就饮食限制而言,诸如蔬果、流食能不能吃等琐碎的问题,就让不少人困扰;经历过清流质饮食的患者中,大约50%都存在心理负担,不愿再次接受结肠镜检查,这对于相

2020-10-26