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基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制

中国南方喀斯特起源古老、分布广泛。该地区气候温和、水分充足,广泛分布的峰林、峰丛、溶洞、天坑等复杂的地貌形态形成独特的岛屿化生境,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。经过漫长的演化,华南喀斯特地区孕育了高度的物种多样性和特有性。喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进化的理解还非常缺乏。全基因组复制(

2020-04-17

Nat Biotechnol:中外科学家联手开发出MEMOTE工具,可用于改善对基因组范围代谢模型的质量控制

2020年3月8日讯/生物谷BIOON/---全基因组范围代谢模型(genome-scale metabolic model, GEM)的应用领域非常广泛,从设计细胞工厂和研究癌症代谢到分析微生物如何在我们的肠道内相互作用。因此,手动和自动生成的全基因组范围代谢模型的出版物数量每年都在增长。这可以被看作是一件积极的事情,但是很多数据对于其他人来说很难在不同的

2020-03-08

国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒基因组序列

国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。

2020-01-30

关于癌症基因组 我们有了全新的认识

今日,最新一期《自然》杂志如约上线,而登上封面的“癌症全基因组”则是本期的主题:在本期《自然》杂志上,一共发表了6篇相关的论文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上,也有系列论文发表。那么,是什么样的研究项目引起了如此的重视呢?具体来看,主导这些研究的是“泛癌症全

2020-02-06

基因组机器学习分析表明武汉2019-nCoV与蝙蝠β冠状病毒之间存在关联

截至2020年2月3日,2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)传播到27个国家,死亡362人,确诊病例超过17000起。科学家们正在将2019-nCoV与臭名昭着的SARS冠状病毒爆发进行比较。在2002年11月至2003年7月期间,SARS在全球导致8098例确诊病例,死亡率为9.6%,死亡774人。仅中国大陆就有349人死亡,5327例确诊病例。尽

2020-02-06

中国古代家犬线粒体基因组研究获进展

 2020年1月8日,《分子生物学与进化》(Molecular Biology and Evolution)在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室研究员付巧妹团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古代家犬线粒体全基因组的研究成果。研究结果表明,所获得的26例

2020-01-15

Science:对人类血细胞中的所有蛋白编码基因进行基因组转录组分析

2019年12月31日讯/生物谷BIOON/---在临床和研究环境中,血液都是对人类进行分子分析的主要来源,并且是许多治疗策略的目标,这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划(www.proteinatlas.org)是一个开放式数据库,旨在通过整合各种组学技术(包括基于抗体的成像)来绘制所有人类蛋白的图谱。以前,人类蛋白质

2019-12-31

Nature:有史以来对人类转移性实体瘤的最大规模基因组研究

2019年12月22日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自荷兰和澳大利亚的多个研究机构的研究人员对转移性实体瘤开展了有史以来最大规模的全基因组研究。相关研究结果近期发表在Nature期刊上。

2019-12-22

研究人员发布基因组单核苷酸变异数据

10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse populations 为题,在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所/马普计算生物学研究所徐书华团队基于20万人

2019-11-03

研究发现藏族人群三代测序高质量参考基因组并解析基因组结构变异

 10月23日,《国家科学评论》杂志在线发布了第一个藏族人群高质量参考基因组。该成果是中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组、西藏大学欧珠罗布与崔超英课题组、中国科学院上海营养与健康研究所徐书华课题组、青海省高原医学科学研究院吴天一课题组等,经过两年多联合攻关完成的藏族人群高原适应研究的又一阶段性成果,旨在利用长片段基因组数据从头组装藏族人群的高质量参考基因组,以期解析藏族人群基因组中的大片

2019-10-30