Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Genetics:单细胞视角下的肿瘤增殖密码——SPRINTER精准解析克隆异质性的新工具
该方法不仅揭示了克隆间增殖率的显著异质性,还关联了高增殖克隆与癌症转移潜力、循环肿瘤DNA(ctDNA)释放等临床重要特征。
2024-12-08
杭州医学院金大智团队在艰难梭菌One Health物种间克隆传播研究中取得新进展
本研究首次发现ST35强大的芽孢形成能力不仅有利于其在各种环境中的生存,而且有助于人与动物(猪)之间的克隆内和种间传播。
2024-10-01
Nat Biotechnol | 揭开肿瘤亚克隆演化之谜:31种算法在模拟肿瘤中的表现评估
为了更好地理解肿瘤的演化过程,研究人员开发了许多基于高通量测序技术的亚克隆重建算法。这些算法利用肿瘤DNA测序数据中的突变特征来推断肿瘤亚克隆的组成和演化历史。
2024-06-13
Cell | 揭示人类胚胎克隆不均衡的奥秘:二细胞阶段已然不对称
该研究通过揭示人类胚胎在早期发育过程中存在的克隆不均衡现象,为我们理解生命起源和胚胎发育提供了重要的科学依据,同时也为临床辅助生殖技术的发展提供了新的思路。
2024-05-17
Cell Stem Cell | 自噬可以恢复衰老造血干细胞的代谢失调和再生能力
这项研究发现衰老的HSC中不同的自噬状态是环境介导的,慢性炎症诱导的糖酵解抑制可以激活自噬,Socs3介导了衰老HSC中的代谢失调和自噬适应,禁食-再进食可以恢复衰老HSC的糖酵解状态和再生能力。
2024-06-18
Nature:揭示蛋白MYCT1在人类造血干细胞自我更新中起着关键作用
本研究发现,MYCT1调节一种叫做内吞(endocytosis)的过程,该过程在造血干细胞如何从环境中接收告诉它们何时自我更新、何时分化、何时处于静止状态的信号方面起着关键作用。
2024-06-26
Cell Stem Cell:侯宇/王军平/窦颖团队揭示造血干细胞抵抗辐射的关键机制
实验结果确定了Nynrin是HSC中线粒体功能的关键调控因子,突出了在癌症治疗期间保留干细胞活力的潜在治疗靶点。
2024-07-04