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研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端

2023-10-07

Redox Biology: 人类NADPH氧化酶中电子转移机制所需的一个以前未被认识到的结构特征

极早发病(VEO)炎症性肠病(IBD)是儿童炎症性肠病(IBD)中发病率上升的一个亚组,受强烈的遗传影响,包括与原发免疫缺陷相关的遗传变异。

2023-10-26

Science:揭示核糖核苷酸还原酶在自由基状态下的三维结构

尽管 DNA 在生物学中发挥着基础性作用,而且半个世纪以来对它进行了大量研究,但 DNA的构成单元(building block)是如何形成的许多方面仍不清楚。如今,在一项新的研究中,来自瑞典斯德哥尔

2023-10-16

Science:从结构上揭示MKK6-p38α复合物激活机制

细胞持续暴露于病原体等应激源,可能会扰乱生物的正常功能。为了对抗应激,细胞产生了多种应对机制,包括炎症反应。虽然炎症反应是必要的,但过多的炎症反应会损害细胞和器官的功能。细胞因子风暴就是这种情况---

2023-09-26

覆盖人工晶体、运动医学,第四批高值耗材国家集采启动

人工晶体类相关耗材为获得中华人民共和国医疗器械注册证的人工晶体耗材(不包括硬性人工晶体、有晶体眼人工晶体)、粘弹剂,同时人工晶体耗材须包含可与其配套使用的推注器。

2023-09-18

Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白

2023-09-27

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

研究揭示异常剪切体蛋白结构

交我算团队专注于提供学科融合服务,帮助全校课题组有效利用高性能计算、AI计算和云计算等强大计算资源。团队由30多人组成,来自物理、化学、生物、材料等多个学科,致力于全校科研计算交叉与创新。

2023-08-14

Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

上海交大唐鸿志团队开发人工合成智能细菌,可时序控制污染物检测、降解并随后自杀

经过模块的逐步整合及针对退化的功能进行优化后,这个整合菌株(Pfic-TAT(2)-P100-RBS35)可以在6小时内响应10–1000 μM的水杨酸;

2023-10-05