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Nat Methods:开发出基于CRISPR/Cas9和单细胞RNA测序的CROP-seq方法

在一项新的研究中,来自奥地利科学院CeMM分子医学研究中心的Christoph Bock及其团队开发出一种新方法:将CRISPR集中筛选和按序筛选(arrayedscreen)的优势结合在一起。通过将CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序整合在一起,他们在单个实验中研究上千个细胞,从而能够平行地确定多种基因的调控影响。

2017-01-23

Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

在一项新的研究中,研究人员开发出一种TT-Seq方法可以用于发现活跃的可控制基因活性的调节性DNA序列。

2016-06-04

解读单细胞RNA-seq技术

多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。我们都参加过大型生日派对:在拥挤的房间里,与许多人聊天、吃饭和庆祝。但

2015-03-26

Nature Methods发布重磅结果:新测序技术——Ribose-seq

核糖核苷酸是RNA的基本单位,它们会在DNA复制和修复过程中嵌入基因组DNA,进而影响基因组的稳定性。然而,迄今为止人们还无法鉴定和定位这些插入DNA的核糖核苷酸。

2015-03-26

BMC Cancer:预示咽癌预后不良的新标志物——SIP1

SIP1蛋白在咽部鳞状细胞癌肿瘤中的表达,往往预示一种晚期的肿瘤分期,一种复发高危及预后不良,据来自东芬兰大学的研究。 基于该结果,SIP1是用于临床使用的潜在新的预后因素,帮助挑出患者更侵袭性的肿瘤行为,需

2014-11-19

系统比较RNA-Seq基因谱

BioRxiv最新收录的文章通过对不同RNA-Seq研究工具的比较来分析哪些工具更胜任转录组研究工作。

2014-05-27

Plant Cell:张忠明等发现SIP2基因调控根瘤的形成

近日,国际植物学权威刊物Plant Cell发表了华中农业大学农业微生物学国家重点实验室张忠明课题组的研究成果。研究人员成功克隆了调控豆科植物共生固氮能力的关键性基因SIP2,该结果将为研究根瘤菌与宿主植物相互作用的分子机制提供新的途径。 尽管空气成分中含有约80%的氮,但一般植物无法直接利用。

2012-03-05