单细胞RNA-SEQ揭示胰腺未分化癌破骨细胞样巨细胞瘤微环境的异质性
在胰腺肿瘤中，未分化癌是一种罕见且高度侵袭性的亚型，其组织学特征往往是高间质、多形性大细胞癌、梭形细胞癌，有时还包括肉瘤样癌。
Molecular Cancer: 单细胞RNA-seq分析发现一种非编码RNA介导肝癌对索拉非尼治疗的耐药性
索拉非尼是一种多激酶抑制剂，是fda批准的一线药物，用于治疗不能切除的肝细胞癌(Hcc)。不幸的是，这些患者的治疗效果微乎其微，总体生存期仅提高了3个月。在初步应答后，大多数肝癌患者出现抗药性和疾病进展。
单链建库技术助力RNA-seq在科研及精准医疗领域应用
近年来，高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式，使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列进行检测成为可能。
Cell：新工具Repair-seq可用于改进CRISPR基因编辑
在第一项新的研究中，美国普林斯顿大学研究员Britt Adamson、麻省理工学院生物系教授Jonathan Weissman、之前在Editas Medicine公司工作的Cecilia Cotta-Ramusino及其同事们详细介绍了一种名为Repair-seq的新方法，它详细地揭示了基因组编辑工具如何发挥作用。
Science：利用RABID-seq分析中枢神经系统炎症中的星形胶质细胞-小胶质细胞相互作用
2021年4月24日讯/生物谷BIOON/---中枢神经系统（CNS）的胶质细胞，包括星形胶质细胞和小胶质细胞，在发育、组织修复和稳态方面发挥着关键作用。然而，星形胶质细胞和小胶质细胞反应失调有助于神经系统疾病发生。事实上，在多发性硬化症（MS）及其模型--实验性自身免疫性脑脊髓炎（experimental autoimmune encephalomyeli
开发出CiBER-seq新技术，可同时分析细胞中的多达100个基因
2020年12月16日讯/生物谷BIOON/---CRISPR-Cas9可以很容易地敲除或调整单个基因，以确定其对有机体或细胞，甚至另一个基因的影响。但是，如果你能一次进行几千个实验，利用CRISPR逐个对基因组中的每一个基因进行调整，并快速看到每一个基因的影响呢，那会怎么样呢？在一项新的研究中，来自美国加州大学伯克利分校的研究人员开发出一种简单的方法来做到
科学家开发出高通量检测单细胞mRNA动态变化的新技术scNT-seq
细胞命运转变以及响应外界信号的过程中会改变细胞类型特异（cell-type-specific）的基因表达，而基因表达的丰度(total RNA level)是由mRNA转录、加工、降解等过程共同决定的。在含有多种细胞类型的复杂组织和系统中，在单细胞水平准确测定这些 mRNA动态变化过程对于理解基因表达调控的重要性不言而喻。传统的mRNA代谢标记技
Nat Biotechnol：开发出可预测基因组编辑器脱靶活性的工具---CHANGE-seq
2020年7月19日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国圣犹大儿童研究医院、卡内基梅隆大学和美国国家标准技术局等研究机构的研究人员开发出一种易于使用的灵敏的高通量的方法，用于确定由CRISPR-Cas9等基因组编辑器引起的非预期的DNA双链断裂的位置。他们将这种方法称为CHANGE-seq（Circularization for High-
Nat Biotechnol：科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2
2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法，日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自西班牙的科学家们通过研究发现，日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源：CC0 Public D
我国科学家实现单细胞表观组学新突破：两种革新单细胞ChIP-seq技术解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾病状态下细胞命运决定调控机制。这两项技术分别于2019年8月27日在Molecular Cell和201