Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
科学家构建涵盖五大植物类群的150+物种参考代谢组及数据库
植物“参考代谢组”是指一个植物物种所有代谢物的总和。一个植物物种“参考代谢组”与代谢物之间的关系,类似于植物物种“参考基因组”与基因之间的关系。
2023-12-04
研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics
近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组研究所(国家生物信息中心)章张、宋述慧团队,开发了大豆多维组学深度整合数据库SoyOmics。
2023-04-10
Nature:通过构建含有20多万张细胞图像的数据库,发现形状相似的细胞具有类似的内部组织
在一项研究中,来自美国艾伦细胞科学研究所的研究人员通过处理数十万张高分辨率图像,对人类细胞的内部组织进行了统计。他们还捕捉到了关于细胞形状丰富变化的细节,即使是在相同条件下生长的基因完全一致的细胞。
2023-01-16
NAR:浙大侯廷军团队报道蛋白降解靶向嵌合体数据库PROTAC-DB 2.0
因此,在2.0版本中,作者利用自主开发的PROTAC-Model建模方法为活性较好的PROTAC分子构建了相应的三元复合物计算模型,辅助研究者进行基于结构的PROTAC理性设计。
2022-11-04