科学家利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱
近日，澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章，利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱。A群链球菌（Group Astreptococcus，GA
报名|2019年西藏民族大学-复旦大学“生命组学大数据分析及能力提升”暑期课程班
暑期课程班一、背景在精准预测、精准预警、精准医疗大背景下，随着基因分型、新一代测序、传感和图像技术的发展与成熟，产生了海量的基因组数据（包括各类常见和罕见变异、insertion/deletion、CNVs等）及转录组、表观基因组、图像、生理生化、临床信息等一系列表型组数据（包括RNA-seq、methylation-seq 和 Chip-seq等），使得大数据分析成为当前研究多基因复杂疾病易感性
微生物组学助力癌症免疫疗法，阿斯利康达成合作
近日，Seres Therapeutics宣布将与阿斯利康（AstraZeneca）开展一项为期3年的研究合作。两家公司将从机理方面去试图理解微生物组学如何增益癌症免疫疗法，包括和阿斯利康产品的潜在协同作用。在两年时间内，阿斯利康将向Seres支付2000万美元的分期付款，并为Seres提供与合作相关的研发经费。Seres仍将保留针对癌症的微生物疗法的权利，但阿斯利康将有权与Seres
中科新生命：生命表型体现者，从“代谢到脂质到修饰”组学专场报告
代谢组学是系统生物学下游的重要组成部分，在biomarker筛选方面具有独特优势，也是病理/药理机制研究的突破口，同时也可以对转录组或蛋白组学的结果做进一步的验证和挖掘，因此在近几年研究中日益突显出其重要的价值。由于小分子代谢物在理化性质、生物变化等方面的特殊性，代谢组的检测分析方法与数据挖掘均与其他组学有较大的差异。
蛋白翻译后修饰组学技术（PTMScan®)在精准医学中的应用
尽管目前大数据的获得会采用基因组学和转录组学，但是核心的发现还是依赖蛋白质组数据而得到的。近来越来越多的研究表明蛋白组学驱动的精准医学具有极大的实用性和普适性，蛋白组学的研究更加速了临床转化的进程。蛋白翻译后修饰（post-translational modification, PTM)赋予了蛋白种类的丰富性及蛋白功能的多样化，研究蛋白翻译后修饰不仅可以确定蛋白修饰（磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、
Science：我国李亦学课题组和杨辉课题组揭示胞嘧啶碱基编辑器诱导大量的单位点脱靶突变
2019年3月2日讯/生物谷BIOON/---基因组编辑在治疗由致命性突变引起的遗传疾病上有很大的潜力。对基因组编辑的脱靶效应进行全面分析是验证这种编辑实用性所必需的。科学家们已开发出多种方法来检测全基因组范围内的基因编辑脱靶位点。然而，这些方法并不适用于检测体内的单核苷酸变异（SNV）。在一项新的研究中，中国科学院的李亦学（Yixue Li）课题组、杨辉（Hui Yang）课题组和美国斯坦福大学
精神分裂症功能基因组学研究中取得进展
精神分裂症是一种以阳性症状、阴性症状和认知障碍为主要特征的严重精神疾病，目前影响了全球约1%的人口。由于病因复杂，反复发作以及大多在青壮年发病，精神分裂症严重影响患者生活，同时也给患者家属和社会带来了沉重的经济和精神负担。精神分裂症的遗传力高达80%左右，表明遗传因素在精神分裂症的发生中有重要作用。近年来，全基因组范围内的关联研究（GWAS）已鉴别到超过180个与精神分裂症显着相关的遗
樟科植物比较转录组学研究获进展
樟科植物在克朗奎斯特分类法中被分到木兰亚纲（Magnoliidae）中，被视为双子叶植物中比较原始的类群。这类植物的萼瓣不分，花瓣和萼片联合在一起，统称花被。樟科树种具有多种经济用途，许多种类的种子富含脂肪酸。然而，这一类群的遗传学与基因组学研究背景十分薄弱，目前仅有鳄梨（Persea americana）、山胡椒（Lindera glauca）和山鸡椒（Litsea cubeba）等
外泌体及其蛋白质组学研究
外泌体是什么？外泌体（Exosome），是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡，具有脂质双层膜结构，直径大约40-200 nm。外泌体存在于体液中，包括血液、唾液、尿液和母乳等，不同组织来源的外泌体在内容物组成和功能方面存在差异，这种差异受到细胞外基质和微环境的动态调控。越来越多的证据表明，宿主细胞或肿瘤细胞分泌的外泌体参与了肿瘤发生、生长、侵袭和转移。对外泌体的分析和检测可以辅助疾病的早
2018年基因组学研究盘点
2018年12月21日/生物谷BIOON/---2018年即将过去，本期为大家带来的是2018年度基因组学领域研究的相关盘点，希望读者朋友们能够喜欢。1. Nature：改写教科书！中国科学家阐明保护卵母细胞独特表观基因组的新型机制！DOI: 10.1038/s41586-018-0751-5在哺乳动物中，雌性机体的卵母细胞数量往往有限，卵母细胞拥有一套独特的表观基因组，其甲基化程度相当于精子的一