Nature Machine Intelligence：发现基于Transformer的多肽-HLA I类结合预测和疫苗的新生抗原序列设计
近日，国际知名期刊《Nature Machine Intelligence》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院魏冬青团队的研究论文《A transformer-based model to predict peptide–HLA class I binding and optimize mutated peptides for v
Nature子刊：一种新技术或能改善血液中癌症DNA的检测
来自MIT等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法，其能以最小的测序规模准确且有效地从患者机体的血液样本中识别出成千上万个DNA突变，这种名为MAESTRO的方法有望帮助检测接受治疗的患者机体的残存癌症病变，从而提醒临床医生患者机体出现的疾病复发，这明显优于目前的技术。
Nature Genetics：科学家揭示人类基因调控元件的序列决定因素
DNA可以决定基因表达的位置和时间，但控制基因表达的全套序列决定因素仍不清楚。近日，芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了题为“Sequence determinants of human gene regulatory elements”的文章。研究人员使用大规模平行报告试验测量了比人类基因组大100倍
Nature Genetics:科学家发现DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础
细胞的全能性在早期胚胎发育中出现，但其分子基础的特征仍不明显。德国慕尼黑大学的研究团队发现，DNA复制叉移动速度是细胞命运变化的基础，并促进细胞重编程。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》上，题为：DNA replication fork speed underlies cell fate changes and promotes rep
熬夜破坏癌症相关基因节律，促进DNA损伤并降低修复效率，增加癌症风险
越来越多的证据表明，夜班工作者中癌症更为普遍，这也促使了世界卫生组织（WHO）国际癌症研究机构在2019年将夜班工作归类为“可能对人类致癌”。但夜班工作究竟为何会增加癌症风险，现在仍不清楚。此外，当代年轻人熬夜现象越来越严重，因为加班、玩游戏、刷短视频等等，主动或被动熬夜已成为许多人的新常态。熬夜是否如夜班工作一样增加癌症风险？美国华盛顿州立大学的研究人员在
揭示DNA结合蛋白高效结合DNA靶序列的新机制
2022年1月28日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自瑞典乌普萨拉大学的研究人员展示了DNA结合蛋白如何在不受到阻碍的情况下在整个基因组中搜索它的靶序列。这一结果与我们目前对基因调控的理解------遗传密码影响DNA结合蛋白的结合频率，但不影响它的结合时间---相矛盾。相关研究结果发表在2022年1月28日的Science期刊上，论文标题为
Nat Genet：延缓DNA复制叉速度可导致细胞命运变化和增强细胞重编程效率
鉴于DNA复制叉（replication fork）的分子特性对调节DNA复制至关重要，来自德国慕尼黑大学和亥姆霍兹慕尼黑中心等研究机构的研究人员着手研究体内全能性细胞和体外培养中的全能样细胞（totipotent-like cell，即类似于全能性细胞的细胞）的复制叉动态。
eLife：揭示蛋白METTL-3和METTL-14可以改变DNA的化学结构
在一项新的研究中，来自美国德克萨斯大学健康科学中心的研究人员认为有可能阻止由白血病和其他癌症中高度活跃的两种蛋白驱动的DNA变化。这为开发未来的药物开发提供新的靶标。
Science：王立平团队等发现大脑序列信息编码的“降维”策略
无论语言沟通、执行动作还是情景记忆，本质上都涉及大脑对时序信息的表征（信息在头脑中的呈现方式）。序列信息编码被认为是人类语言句法结构的前提，对机器学习领域产生重大影响，但对其编码机制人们却知之甚少。中科院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）研究员王立平团队、上海脑科学与类脑研究中心副研究员闵斌和北京大学生命科学学院教授唐世明