科学家开发出高通量检测单细胞mRNA动态变化的新技术scNT-seq
细胞命运转变以及响应外界信号的过程中会改变细胞类型特异(cell-type-specific)的基因表达,而基因表达的丰度(total RNA level)是由mRNA转录、加工、降解等过程共同决定的。在含有多种细胞类型的复杂组织和系统中,在单细胞水平准确测定这些 mRNA动态变化过程对于理解基因表达调控的重要性不言而喻。传统的mRNA代谢标记技
Nat Biotechnol:开发出可预测基因组编辑器脱靶活性的工具---CHANGE-seq
2020年7月19日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院、卡内基梅隆大学和美国国家标准技术局等研究机构的研究人员开发出一种易于使用的灵敏的高通量的方法,用于确定由CRISPR-Cas9等基因组编辑器引起的非预期的DNA双链断裂的位置。他们将这种方法称为CHANGE-seq(Circularization for High-
Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2
2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法,日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自西班牙的科学家们通过研究发现,日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源:CC0 Public D
我国科学家实现单细胞表观组学新突破:两种革新单细胞ChIP-seq技术解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项(批准号:2017YFA0103402)等资助下,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈,开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术,可适应于不同课题研究需要,解析发育与疾病状态下细胞命运决定调控机制。这两项技术分别于2019年8月27日在Molecular Cell和201
微流控自动化技术革新RNA-Seq文库构建流程 --- FLUIDIGM发布更高效、更节约成本的Advanta RNA-Seq NGS 文库构建解决方案
作为不断创新的生物科技领导者,Fluidigm公司长期致力于通过全方位的健康洞察力来改善人们的生活。近日,Fluidigm公司发布了最新的Advanta RNA-Seq NGS 文库制备解决方案。该方案利用微流控自动化技术,为RNA-seq二代测序文库制备流程带来突破性的变革,不但极大提高了中高通量实验室的工作效率,同时也大幅降低了实验成本。Advanta™ RNA-Seq NGS L
Nat Methods:开发出一种新的基因组学工具ECCITE-seq,可扩展多模式单细胞分析
2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国纽约基因组中心的研究人员开发出一种称为ECCITE-seq的新技术,它允许科学家们对来自单细胞的多种信息模式进行高通量测量。相关研究结果发表在2019年5月的Nature Methods期刊上,论文标题为“Multiplexed detection of proteins, transcriptomes, clonotype
Science:开发出一种检测CRISPR脱靶效应的新方法---DISCOVER-Seq
2019年4月20日讯/生物谷BIOON/---自从CRISPR基因组编辑技术于2012年发明以来,它已经显示出治疗许多难治性疾病的巨大希望。然而,科学家们一直在努力在治疗相关的细胞类型中鉴定潜在的脱靶效应,这仍然是将治疗方法转移到临床应用的主要障碍。如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校、加州大学旧金山分校、格拉德斯通研究所和瑞典阿斯利康公司的研究人员开发出一种可靠的方法来实现这一目
Lab on a Chip:新研究快速检测细菌耐药性的产生
2019年3月15日 讯 /生物谷BIOON/ --科学家已经开发出一种新的,更快速的测试方法,用于确定单个细菌如何对抗生素产生反应,这可能有助于抵抗抗菌素耐药性。了解药物如何影响单一细菌可以帮助临床医生更快地针对正确的抗生素,减少长期治疗的需要。目前检测细菌药物耐受性的方法是通过测试细菌在药物环境中生长及其对药物的反应得到的。然而,由于细菌生长是一个缓慢的过程,测试可能需要时间并且可能不太准确。
Lab on Chip:新型黏性机器人能够快速检测疾病
2019年2月15日 讯 /生物谷BIOON/ --人体组织会经历各种机械刺激,这些机械刺激可以影响它们执行其生理功能的能力,例如保护器官免受伤害。研究表明,在体内和体外对活组织进行相关刺激有助于病症的研究。在EPFL,Selman Sakar的研究团队开发了能够机械刺激细胞和微组织的工具。这些工具由细胞大小的人造肌肉提供动力,可以在微观尺度上在生理条件下执行复杂的操作任务。(图片来源:www.p
开发出cfMeDIP–seq技术,最低仅需1ng血浆cfDNA就可检测早期癌症
2018年11月15日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,在加拿大玛嘉烈公主癌症中心研究员Daniel De Carvalho博士的领导下,一个研究团队以血液样本作为测试对象,将“液体活检”、甲基化分析和机器学习相结合,开发出一种灵敏的基于免疫沉淀的测试方法来分析少量血浆循环游离DNA(cell-free DNA, cfDNA)中的甲基化组(methylome),从而能够在癌症的最早阶段检