Nature Genetics:基因调控的精准地图——ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
通过将多种蛋白质与DNA的结合关系同时映射,ChIP-DIP 为我们提供了一个全新的视角,使得研究人员可以在一个实验中并行检测多个蛋白质的DNA结合模式,从而更加全面、精确地揭示基因调控的动态变化。
Nature Genetics:基因调控的精准地图:ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
ChIP-DIP技术的出现,为基因调控的研究打开了一扇全新的大门。通过并行分析多个蛋白质-DNA相互作用,ChIP-DIP不仅显著提高了研究效率,还揭示了基因调控网络的复杂性和动态性。
Cell:利用Perturb-seq技术大规模探究与关键发育基因相关的脑细胞类型
研究人员发明了一种名为体内Perturb-seq的新技术。这种方法利用CRISPR-Cas9技术和单细胞转录组分析,一次一个细胞地测量对细胞的影响。
Cell:新研究指出人类scRNA-seq 数据集存在隐私泄露风险,应加强保护
利用不同实验室生成的数据,甚至用不同方法处理的数据,然后用它来将完全不同的匿名数据集中的个体关联起来,这种能力相当惊人,而且凸显了单细胞数据的真正隐私问题。
Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质可及性图谱
SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。
Brief Bioinform | ChIP-GPT:改革生物医学数据库记录提取的大型语言模型
ChIP-GPT的设计旨在识别和提取关键元数据,例如染色质免疫沉淀(ChIP)目标和细胞系,从而支持大规模的生物医学分析。
Nature子刊:何川团队开发RNA结合蛋白靶点检测新方法——ARTR-seq
在这项研究中,何川团队为了克服现有方法的局限性,提出了一种基于逆转录酶(RT)的RBP结合位点测序方法——ARTR-seq,通过原位逆转录酶捕获RBP-RNA相互作用。
Nature:利用FIND-seq成功分离和分析在多发性硬化症中发挥关键作用的星形胶质细胞亚群
在一项新的研究中,研究人员通过结合核酸细胞仪、微流控技术和液滴分选,开发出FIND-se,可根据数字液滴PCR检测的mRNA生物标志物的表达来分离和分析感兴趣的罕见细胞。
重磅 | 人人可及,时空组学技术Stereo-seq再次升级
未来,时空组学将朝着智慧实验室、多样本多组学、便捷与开放的平台方向,打造全方位的时空生态系统,降低科学发现的门槛,赋能更多领域的科学研究。
Science:我国科学家利用单细胞Stereo-seq揭示损伤诱导的室管膜胶质细胞亚群参与蝾螈大脑再生
大脑再生需要以时间和区域特定的方式协调复杂的反应。确定参与这一过程的细胞类型和分子将促进我们对大脑再生的理解,并为再生医学研究提供潜在的靶标。