Genome Biol:开发出NT-seq方法,可同时检测细胞中的三种不同类型的DNA甲基化
细胞控制它们的基因活性的一种方式是在DNA上添加小的化学修饰,以决定哪些基因开启或关闭。
单细胞RNA-SEQ揭示胰腺未分化癌破骨细胞样巨细胞瘤微环境的异质性
在胰腺肿瘤中,未分化癌是一种罕见且高度侵袭性的亚型,其组织学特征往往是高间质、多形性大细胞癌、梭形细胞癌,有时还包括肉瘤样癌。
Global Change Biology:揭示氮富集提高土壤微生物碳利用效率的新机制
工业革命以来,化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持续的氮输入会显著改变陆地生态系统结构和功能。
Science:利用Record-seq技术记录肠道细菌的基因表达
在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、巴塞尔大学、伯尔尼大学和博特纳儿童健康研究中心的研究人员为肠道细菌配备了数据记录器功能,以此来监测肠道细菌中哪些基因是活跃的。
Molecular Cancer: 单细胞RNA-seq分析发现一种非编码RNA介导肝癌对索拉非尼治疗的耐药性
索拉非尼是一种多激酶抑制剂,是fda批准的一线药物,用于治疗不能切除的肝细胞癌(Hcc)。不幸的是,这些患者的治疗效果微乎其微,总体生存期仅提高了3个月。在初步应答后,大多数肝癌患者出现抗药性和疾病进展。
单链建库技术助力RNA-seq在科研及精准医疗领域应用
近年来,高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式,使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列进行检测成为可能。
Cell:新工具Repair-seq可用于改进CRISPR基因编辑
在第一项新的研究中,美国普林斯顿大学研究员Britt Adamson、麻省理工学院生物系教授Jonathan Weissman、之前在Editas Medicine公司工作的Cecilia Cotta-Ramusino及其同事们详细介绍了一种名为Repair-seq的新方法,它详细地揭示了基因组编辑工具如何发挥作用。
Science:利用RABID-seq分析中枢神经系统炎症中的星形胶质细胞-小胶质细胞相互作用
2021年4月24日讯/生物谷BIOON/---中枢神经系统(CNS)的胶质细胞,包括星形胶质细胞和小胶质细胞,在发育、组织修复和稳态方面发挥着关键作用。然而,星形胶质细胞和小胶质细胞反应失调有助于神经系统疾病发生。事实上,在多发性硬化症(MS)及其模型--实验性自身免疫性脑脊髓炎(experimental autoimmune encephalomyeli
开发出CiBER-seq新技术,可同时分析细胞中的多达100个基因
2020年12月16日讯/生物谷BIOON/---CRISPR-Cas9可以很容易地敲除或调整单个基因,以确定其对有机体或细胞,甚至另一个基因的影响。但是,如果你能一次进行几千个实验,利用CRISPR逐个对基因组中的每一个基因进行调整,并快速看到每一个基因的影响呢,那会怎么样呢?在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校的研究人员开发出一种简单的方法来做到
科学家开发出高通量检测单细胞mRNA动态变化的新技术scNT-seq
细胞命运转变以及响应外界信号的过程中会改变细胞类型特异(cell-type-specific)的基因表达,而基因表达的丰度(total RNA level)是由mRNA转录、加工、降解等过程共同决定的。在含有多种细胞类型的复杂组织和系统中,在单细胞水平准确测定这些 mRNA动态变化过程对于理解基因表达调控的重要性不言而喻。传统的mRNA代谢标记技