Nat Genet:何厚胜/Ming Tsao合作揭示表观遗传调控因子MEN1在肿瘤及其微环境相互作用上的双重功能
研究人员首次深入阐明了MEN1, MLL1与DNA结合的表观遗传学分子机理。基于这一机理,作者提出单独使用药物抑制MEN1或与免疫治疗联合可能会给实体瘤患者带来一种新的免疫治疗方法。
Immunity | 王毅全/吕惠彬等开发记忆B细胞语言模型用于抗体特异性预测
研究团队开发了记忆B细胞语言模型(mBLM),使其学习功能性抗体的内在“语法”,并进一步区分血凝素(HA)头部和茎部抗体以及针对其他抗原的抗体。
Nature Medicine:循环肿瘤DNA预测癌症相关静脉血栓风险:液体活检引领精准医疗新方向
该研究首次系统性验证了ctDNA作为癌症相关VTE的独立预测因子,特别是在高风险癌症患者中,ctDNA能够显著提高VTE风险的预测准确性。
Sci Rep:科学家识别出能预测人类胃癌复发风险的潜在新型生物标志物
本文研究结果表明,在诊断过程中引入AF1q或许能促进对患者的筛查、预后评估以及考虑对有资格进行择期手术的患者进行术前的多模式治疗。
Dev Cell:陈国强团队报道PTEN作为细胞因子通过结合其在巨噬细胞表面特异表达的PLXDC2受体驱动抗肿瘤免疫
该研究在揭示了PTEN影响肿瘤免疫微环境的新机制的同时,为靶向PTEN的肿瘤治疗提供了理论基础。
Science:利用AlphaFold2结构预测可指导潜在的候选药物发现
在数以亿计的潜在组合中,使用 sigma-2 AlphaFold2 蛋白模型预测的药物-蛋白相互作用有54%通过一种结合的候选药物成功激活。sigma-2的物理模型也产生了类似的结果,成功率为51%。
Mol Cell | 李笑雨/伊成器团队合作开发不依赖于亚硫酸氢盐RNA m⁵C单碱基测序检测方法
该研究开发了直接检测m5C修饰的新技术m5C-TAC-seq,并展示了m5C-TAC-seq技术高灵敏、高精准的检测特性。
PNAS丨厦门大学曹彬团队合作发现决定人类及小鼠胎盘滋养层细胞合体化的全新转录因子
该研究首次揭示转录因子TFEB在人类及小鼠胎盘滋养层细胞合体化过程中的保守性调控作用,阐明了mTORC1-TFEB-ERVFRD-1作用轴介导滋养层细胞融合的全新分子调控路径。
Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具,还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。
徐华强团队证实,AlphaFold3预测GPCR-配体复合物结构准确性不足
该研究为在GPCR研究中使用AlphaFold3的研究人员提供了有价值的见解,强调了基于实验的结构确定的必要性,并为未来在计算模型中改进蛋白质-配体相互作用预测提供了方向。