Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础
Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。
2024-05-26
Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。
2024-05-27
Nature:从随机搜索到精准激活——翻译起始的新机制
研究发现,eIF4F不仅能够随机探索mRNA的不同位置,还能通过其内部亚基间的协作,在识别帽端时表现出独特的“选择性”和“活化”模式。
2024-12-18
Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理
通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。
2024-09-26
Nature:我国科学家揭示脊椎动物旁着丝粒异染色质起始的保守机制
这项新的研究揭示了组成性旁着丝粒异染色质的从头建立机制,并解释了为什么脊椎动物中明显非保守的旁着丝粒异染色质序列仍然具有相同的组蛋白H3K9me3修饰。
2024-07-15
大学池塘中的神奇生物,基因转录规则“与众不同”
DNA就像建筑物的蓝图,它本身不做任何事情但下达必要的指令。为了让基因产生影响,必须先读取DNA,再将其构建成具有物理效应的分子。
2024-07-15
转录因子早期生长反应3 (Egr3)是心脏瓣膜形态发生所需的机械敏感转录因子基因
本研究揭示了一个以前未知的信号轴,其中EGR3是转导心脏瓣膜形成所需的机械信号所必需的,也可能是左室AD瓣膜重塑所需的机械信号。
2024-05-27
Cancer Cell:王存/高强/覃文新团队提出免疫治疗新策略——靶向肿瘤起始细胞免疫特权,增强癌症免疫治疗
研究团队提出联合靶向PD-1和CD155的治疗策略,不仅能够清除这些肿瘤起始细胞,还能减少肿瘤微环境中免疫抑制性中性粒细胞的浸润。
2024-11-20
Science:剪接体对RNA转录本的编辑延迟会导致细胞死亡
在这项新的研究中,这些作者如今发现了一种以更微妙的方式干扰剪接过程的机制。它与剪接体的一个由三种亚基U4、U5 和 U6组成的特定部分有关。
2024-11-28
Nature:转录与翻译的协奏曲!揭示基因表达耦合的新调控模式
研究人员首次在实验室中重建了完整的转录-翻译偶联系统,并利用多色单分子荧光显微镜技术,实时追踪了转录延伸、翻译延伸以及两者之间的耦合。
2024-12-13