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Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制

该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。

2024-07-04

代谢与表观遗传的答案

CD8+ T细胞从功能正常到逐渐耗竭,其代谢模式从偏好乙酸(acetate)转向更依赖于葡萄糖(glucose)。

2025-01-03

Cell Genomics:刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录跨模态整合分析的AI框架——UniTCR

UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架,以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。

2024-05-06

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Mol Cell | HDACs调控异染色质沉默和表观遗传的分子机制

研究结果表明,表达靶向异染色质的Snf5会阻碍异染色质的表观遗传信息传播,而这是通过抑制Clr4的读写机制影响了H3K9me3修饰的延伸。

2024-08-22

脂肪组织在减肥后保留了肥胖的表观遗传记忆

研究发现,肥胖会导致脂肪细胞的细胞核发生特征性的表观遗传变化,这些变化的特别之处在于,即使在节食之后,它们依然存在。

2024-12-01

大学池塘中的神奇生物,基因转录规则“与众不同”

DNA就像建筑物的蓝图,它本身不做任何事情但下达必要的指令。为了让基因产生影响,必须先读取DNA,再将其构建成具有物理效应的分子。

2024-07-15

Science:新研究揭示表观遗传学如何影响哺乳动物记忆形成

小鼠研究结果表明,神经元的表观遗传状态是它在记忆编码中发挥作用的关键。

2024-08-04

Cell:新研究揭示中风改变免疫系统的表观遗传学机制

研究发现,身体其他部位出现功能障碍的根源在于骨髓造血细胞的免疫记忆。

2024-08-01