复旦大学在Cell期刊上发文，从基因组学角度揭示SARS-CoV-2的起源和出现
2020年3月31日讯/生物谷BIOON/---新型人类冠状病毒SARS-CoV-2（之前称为2019-nCoV）的持续大流行引起了全球的极大关注。我们和中国的其他人参与了对这种病毒的初始基因组测序。在本文中，我们描述了针对SARS-CoV-2的出现，这些基因组数据揭示了什么，并讨论了我们对其起源理解上的差距。一种新的人类冠状病毒2019年12月下旬在中国湖
Nat Biotechnol：中外科学家联手开发出MEMOTE工具，可用于改善对全基因组范围代谢模型的质量控制
2020年3月8日讯/生物谷BIOON/---全基因组范围代谢模型（genome-scale metabolic model, GEM）的应用领域非常广泛，从设计细胞工厂和研究癌症代谢到分析微生物如何在我们的肠道内相互作用。因此，手动和自动生成的全基因组范围代谢模型的出版物数量每年都在增长。这可以被看作是一件积极的事情，但是很多数据对于其他人来说很难在不同的
Nat Biotechnol：利用反向遗传学产生的特异性抗体捕获不可培养的细菌
2020年2月8日讯/生物谷BIOON/---细菌和古生菌构成了生命世界的绝大部分，但是它们中的绝大部分物种，包括与人类有密切关联的物种，从未被分离或培养过。对来自自然微生物种群的DNA进行测序已可以鉴定以前未知的分类群（taxa），在某些情况下还提供了有关这些有机体的详细基因组信息。美国加州大学圣地亚哥分校微生物学家Karsten Zengler说，但是拥
Science：新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子
2019年12月20日讯/生物谷BIOON/---肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子，它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点；少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性，并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是，在大多数情况下，这些分子的生产尚未与特定的细菌菌株或代谢途径相关联在一
中国科学家揭示乙肝病毒相关性肝癌的多维蛋白基因组学特征
肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma，HCC）是全球第四大癌症死亡原因，占所有原发性肝脏恶性肿瘤的85%-90%。HCC诱发的主要原因包括乙型肝炎病毒（Hepatitis B Virus，HBV）和丙型肝炎病毒（Hepatitis C Virus，HCV）慢性感染、酗酒以及代谢综合征。其中，85%的中国HCC患者是由HBV感
第十四届国际基因组学大会（ICG-14）正式开幕
2019年10月25日上午，第十四届国际基因组学大会（The 14th Annual Meeting of International Conference on Genomics，以下简称“ICG-14”）在深圳国家基因库正式开幕。来自全球的顶尖科学家和创新者齐聚深圳，他们将通过主题演讲、专题研讨和成果演示的方式，与ICG-14参会者们分享他们的成果与观点。国际基因组学大会是由华大主办的全球生命
Science：利用单细胞基因组学进行人类细胞表型分析
2019年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一篇近期发表在Science期刊上的标题为“Mapping human cell phenotypes to genotypes with single-cell genomics”的综述类型文章中，瑞士研究人员认为在了解构成人体的细胞表型和人类基因组如何被用来构建和维持每个细胞的目标中，我们正处在一个迷人的旅程中。瑞士巴塞尔分子与临床眼科研究所
施维雅/大鹏制药新型抗代谢复方药Lonsurf在胃切除亚组中显著改善生存
2019年10月18日/生物谷BIOON/--法国药企施维雅（Servier）与合作伙伴大鹏制药（Taiho Pharmaceutical）近日联合宣布，评估Lonsurf（trifluridine/tipiracil）治疗转移性胃癌或胃食管交界腺癌成人患者的III期TAGS研究的详细结果已发表于JAMA Oncology杂志10月刊上。TAGS是一项随机、双盲研究，在对标准疗法难治的转移性胃癌或
我国科学家实现单细胞表观组学新突破：两种革新单细胞ChIP-seq技术解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾病状态下细胞命运决定调控机制。这两项技术分别于2019年8月27日在Molecular Cell和201
我国曹雪涛课题组揭示m6A介导的细胞代谢重编程抑制病毒感染机制
2019年9月28日讯/生物谷BIOON/---病毒感染可以调节宿主细胞的代谢，从而影响病毒的存活或清除。RNA修饰，特别是最为常见的哺乳动物mRNA修饰---N6-甲基腺苷（m6A）---能够调节基因表达和病毒感染。比如，m6A甲基转移酶复合物组分METTL3/14限制寨卡病毒产生，而m6A去甲基酶ALKBH5和FTO增强这种病毒的产生。在病毒和宿主之间的相互作用中，由m6A修饰介导的细胞代谢重