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Nature Methods:如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?

随着单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)等技术的引入,研究人员得以从单个细胞的角度揭开胚胎发育的秘密,描绘出生命起始的动态蓝图。

2024-11-24

Nature Methods : 如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?

研究人员借助干细胞技术构建了胚胎模型(stem cell-based embryo models),用于模拟人类胚胎的发育。

2024-12-09

Nat Cell Biol:单细胞RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理

通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。

2024-09-26

Nature Aging:单细胞RNA测序揭示卵巢衰老的具体机制

总的来说,该研究提供了促进慢性卵巢炎症和纤维化随年龄增长的潜在机制的见解,并为该领域提供了重要的资源。

2024-01-18

Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点

DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。

2024-10-16

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。

2024-06-12

单细胞RNA测序,揭示不同血管化策略对大脑类器官的影响

血管化的大脑类器官不太可能发生细胞死亡,因此被认为是未来大脑研究的标准。这项研究对于未来血管化类器官的制造至关重要,有望开发出更高保真的血管化类器官。

2023-12-22

单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Cell:小核仁RNA:调控细胞衰老的幕后推手

这项研究通过全基因组筛选,发现了一种保守的snoRNA:SNORA13,它是人类细胞和小鼠衰老所必需的,SNORA13能够负调控核糖体生物合成,直接与RPL23相互作用从而促进p53激活和细胞衰老。

2024-08-23

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20