Genome Biology:开发出单细胞基因组单分子测序新方法
单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALB
Science:利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合,可能会在哺乳动物胚胎发育过程中,通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象:一个受精
Nature Communications:RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础
RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结
单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现取得进展
肿瘤微环境具有高度异质性,深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征,对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来,单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器,在相关研究中取得了一系列突破进展,包括揭示肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化关系以及这些免疫细胞在不同肿瘤免疫治疗中的潜在功能。近日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、
Nature 子刊:单细胞测序揭秘治疗白血病的新方法
急性髓细胞性白血病(AML)是一类起源于白血病干细胞(LSC)的恶性克隆性疾病,但由于癌症干细胞的丰度低且与健康的造血干细胞(HSC)具有高度相似性而难以分离,因此阻碍了国际上针对靶向人体恶性细胞同时保留正常细胞的精密治疗方法的研究。
Nature:单细胞测序法为根治白血病开辟新途径
急性髓细胞性白血病(AML)是一类起源于白血病干细胞(LSC)的恶性克隆性疾病,但由于癌症干细胞的丰度低且与健康的造血干细胞(HSC)具有高度相似性而难以分离,因此阻碍了国际上针对靶向人体恶性细胞同时保留正常细胞的精密治疗方法的研究。近日,西班牙基因组调控中心(CRG)和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员在《Nature Co
新型单细胞技术揭示免疫检查点调节新机制
免疫检查点分子是调节免疫应答激活与抑制平衡的关键分子。在正常生理状态下,抑制性免疫检查点在自身耐受和自身免疫防御中发挥重要作用,但在肿瘤患者中,抑制性免疫检查点表达上调,导致免疫逃逸。例如,抑制性免疫检查点CD274(也称为PD-L1)与T细胞上的程序性细胞死亡(PD)-1受体相互作用以抑制T细胞活化,在许多癌症中过表达。目前,通过阻
科学家利用单细胞成像技术或能完全定义肿瘤微环境的代谢状态!
2021年2月28日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Cell Reports上题为“Single-cell resolved imaging reveals intra-tumor heterogeneity in glycolysis, transitions between metabolic states, and their
单细胞测序技术如何助力人类多种疾病的研究?
本文中,小编盘点了科学家们发表的多篇重要研究报告,共同解读他们如何利用单细胞测序技术来助力人类多种疾病的研究,分享给大家! 【1】Nat Med:单细胞测序揭示胃癌患者差异化结局的原因doi:10.1038/s41591-020-1125-8近日,一项刊登在国际杂志Nature Medicine上的研究报告中,来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研
揭示利用新开发的ExSeq测序技术高分辨率确定RNA在细胞中的位置
2021年1月29日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员利用一种新的组织扩张技术,设计了一种方法,对组织样本中的信使RNA(mRNA)分子进行标记,然后对mRNA进行测序。相关研究结果发表在2021年1月29日的Science期刊上,论文标题为“Expansion sequencing: Spatially