Journal of Advanced Research: 转录组关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路
研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。
2024-07-30
Cell系列综述:刘光慧团队在单细胞水平上概述代谢衰老的异质性
该综述详尽地概述了代谢衰老在组织和细胞异质性上的特征,并分析了这些异质性对干预措施的反应。同时深入剖析了衰老过程中关键代谢途径的脆弱性,并评估了在不同器官和细胞类型中代谢衰老干预策略的效能。
2024-10-07
Cell子刊:韩敬东团队开发机器学习程序,在单细胞水平识别衰老细胞
该研究开发了一种机器学习程序——SenCID(Senescent Cell Identification),它可以准确地识别bulk转录组和单细胞转录组数据中的衰老细胞。
2024-04-17
Nature Methods | GPT-4在单细胞分析中的突破:高效的细胞类型识别
该研究不仅证实了GPT-4在生物医学领域的应用潜力,同时也为单细胞RNA测序分析中的细胞类型标注提供了一种新的、高效的解决方案。
2024-04-06
空间组学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析
此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。
2024-08-14
Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法
结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。
2024-10-02
Nature:单细胞多组学研究揭示唐氏综合征儿童易患白血病的原因
这项单细胞多组学研究为唐氏综合征胎儿造血提供了高分辨率分子图谱,并表明唐氏综合征患者细胞基因组中存在显著的调节重构,从而导致他们易患白血病等血液学疾病。
2024-10-03
Nature Methods | 革新癌症治疗:EpiChem技术揭示药物与染色质结合的单细胞层面机制
EpiChem为在单细胞水平上解析小分子药物与基因组相互作用及其表观基因组状态提供了一种独特的方法。这一技术的潜在应用范围广泛,从药物开发到理解细胞异质性,都具有重要意义。
2024-07-24
Nat Methods | 单细胞三维基因组与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程
该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。
2024-04-17