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Nat Commun:通过整合细胞形态学和空间转录学深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

【日程发布】2025第四届长三角单细胞学技术应用论坛暨空间学前沿论坛新春重磅呈现,大咖云集,免费注册中!

作为2025开年之作,“第四届长三角单细胞组学技术应用论坛暨空间组学前沿论坛”将于2025年2月28日-3月1日在中国·上海召开

2025-02-11

单细胞图谱如何‘活’起来?

单细胞图谱正在让精准医学从愿景走向现实。从精准诊断到靶向治疗,再到个体化医疗,这张不断完善的“细胞地图”,将引领我们走向一个更健康、更精准的医学新时代。

2024-12-22

单细胞和空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

研究开发出通用型高通量单细胞多组学新技术

该团队自主研发了新型单细胞多组学测序技术UDA-seq,基于组合标记技术路线优化升级广泛使用的液滴微流控平台,实现了细胞通量和假单细胞率的“解偶联”,突破了通量限制。

2025-01-30

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录实时测序新技术

该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。

2024-11-03

Nature:中外科学家联手揭示结直肠癌的预后基因转录特征

在这篇首次发表的研究论文中,研究者发现了将近100个发生突变的癌症驱动基因。其中,9 个是结直肠癌中的新型基因,24 个是任何癌症的新型基因。

2024-08-15

Nature Methods:单细胞研究的新突破!iFlpMosaics如何精准解码基因功能?

该工具结合了Flp重组酶技术和多光谱荧光标记技术,通过对细胞进行精确的基因操控和标记,实现了突变细胞与野生型细胞在同一微环境中的共存和分析。

2024-12-31

深度学习与空间转录学的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01