科研人员发表关于单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用的综述文章
该文章介绍了多种前沿单细胞组学实验技术和空间组学实验技术并总结了常见的应用场景,剖析了这些新兴技术应用于肝脏样本可能产生的问题及潜在的实验或计算生物学解决方案。
EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制
果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细
Nature:新研究在单细胞分辨率下绘制出人类肠道的空间图谱
当你想到自己理想中的社区时,也许你会想到绿树成荫的街道,或者一个紧密团结、互相帮助的社区。你很可能不会想到你的消化系统。
华大智造发布两款单细胞组学新品,助力单细胞多组学标准化、规模化发展
未来,华大智造将进一步深耕单细胞组学领域,发挥自身在基因测序设备领域、实验室自动化领域的优势,为规模化的科学研究、为单细胞组学全面进入临床及精准健康研究,提供更为优质、标准的系列产品组合
Cell:世界首套单细胞分辨率的猕猴大脑皮层细胞空间分布图谱发布
该研究产生了较为完整的世界首套猕猴全脑皮层的单细胞以及空间转录组数据,为后续的相关研究提供了重要的数据资源库,现已实现公开共享。
我国科学家构建出猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱
在一项新的研究中,来自中国多家研究机构的研究人员利用自主研发的空间转录组测序技术Stereo-seq以及snRNA-seq技术,绘制了猕猴大脑皮层细胞类型分类图谱,揭示了细胞类型组成与灵长类动物各个脑
Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法
该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录
空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展
目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。
迄今最大规模研究破解持久性CAR-T细胞转录组特征
Ghorashian团队认为,他们这个研究最重要的发现是发现了持久性CAR-T细胞的独特转录特征。而且这个特征在不同人群、不同CAR-T疗法中也存在。因此这暗示着,这种独特的转录特征有可能代表了持久性
单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式
这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角