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安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用

利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。

之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案,本期将要介绍的SureSelect XT HS2 RNA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性,靶向富集的RNA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化,样品起始量可低至10ng;试剂盒提供384对双端样本标签,接头序列中引入了分子标签,极大降低了测序中标签跳跃问题, 在去除Duplication时更准确;该试剂盒对整体建库流程进行了优化,建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 RNA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程,两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和RNA的平行建库。

直播时间:2020-11-26

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题答疑

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

本次讲座将介绍安捷伦最新推出的 SureSelect XT HS2 DNA 试剂盒,看它如何破解上述难题,并为使用者带来最大的灵活性。

本次讲座将覆盖:
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 的特点与实际表现
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 如何解决标签跳跃问题
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 如何降低假阳性读数,提升结果准确性
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 的其它灵活性能
* 安捷伦二代测序整合解决方案

直播时间:2020-03-17

安捷伦基因组学系列讲座 —— 超长片段 DNA 样本分离与质控的终极解决方案

脉冲场电泳可以分离几十 Kb 的超长片段 DNA,然而传统的脉冲场电泳动辄就要运行过夜,实验结果还受诸多外界因素影响。当样本量很大,时间是个关键因素时,该如何解决?本次讲座,我们将向您系统阐述脉冲场电泳的基本原理,您将了解到最先进的十倍于传统脉冲场电泳速度的 Femto Pulse 全自动脉冲场电泳系统,以及 Femto Pulse 系统如何解决三代测序样本质量控制的问题。
讲座概要:
1. 脉冲场电泳的基本原理
2. 安捷伦 Femto Pulse 全自动脉冲场电泳系统
3. 全自动脉冲场电泳系统用于三代测序的样本质量控制

直播时间:2019-12-18

安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念

实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。
本次讲座将覆盖:
* 安捷伦高随机性酶切片段化方案
* 安捷伦 SureSelect XT HS/Low Input 分子标签与低起始量建库方案

直播时间:2019-11-27