中国科学技术大学单革教授在线讲解“环RNA种类和功能”
单革，中国科学技术大学教授，博士生导师。单革博士长期从事基因表达调控和非编码RNA功能及功能机理方面的研究。
发现了新的非编码RNA类型（mecciRNA、EIciRNA、5S-OT、ASAT siRNA、p53点突变适配体RNA等）、研究了新的非编码RNA功能、揭示了新的非编码RNA作用机理、探索了新的非编码RNA研究方法。实验室成立以来先后在Genome Biology, Developmental Cell，Nature Structural & Molecular Biology，Nature Communications, Science Advances和PNAS等期刊发表多篇非编码RNA领域的研究论文。
承担基金委面上、重点项目；科技部“国家重点研发计划”项目负责人（环境应激和营养失衡所致获得性性状及其代际传递机制，2019.12-2024.11）。获2020年度安徽省科学技术奖（自然科学奖一等奖，项目名称“新非编码RNA的发现、功能及相关调控”，第一完成人）。任中国生物化学与分子生物学会核糖核酸RNA专业分会（RNA Society, CSBMB）副主任委员，Non-coding RNA Research副主编（Associate Editor）。获得科技部“中青年科技创新领军人才”（2016），基金委“国家杰出青年基金”（2017），国家 “万人计划”科技创新领军人才（2018）。
纳米孔长读长直接RNA测序与应用介绍
RNA测序（传统测序技术称为RNA-Seq）已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。它是研究发育生物学、人类遗传学和疾病相关病理学的宝贵工具。
基于短读长测序的RNA分析均需将RNA转化为互补DNA（cDNA）链，在这一过程中，逆转录或扩增可引入偏倚，且并非所有的转录物都以相同的效率扩增，这就会导致一些种类的RNA的中断以及其它种类RNA的过度扩增，同时在PCR扩增过程中会丢失有关碱基修饰的所有信息。
长读长纳米孔 RNA 测序能够以完整的全长序列对天然 RNA 或 cDNA 进行准确定量和鉴定，无需片段化或扩增，简化分析，并消除了潜在的偏好性来源。直接 RNA 测序还可以同步识别碱基修饰和核苷酸序列，目前纳米孔直接RNA测序能够处理的最长转录本目前长度超过20kb。
来自中国和世界各地的科学家已经将纳米孔RNA测序提供的众多独有优势运用到了各个不同领域，我们邀请到多个领域的研究者们在近期为大家带来纳米孔转录组测序系列研究讲座，分享他们利用纳米孔测序进行RNA研究的经验与成果。
首期，6月3日，我们邀请到福建农林大学林学中心席飞虎，武汉贝纳科技有限公司 副总经理陈虎，在线上带来他们利用纳米孔长读长测序平台进行直接RNA测序研究的实战经验和研究成果。
会议日程
| 时间 | 主题 | 讲师 |
| 15:00-15:15 | 欢迎与直接RNA测序及应用介绍 | 王小薇 Oxford Nanopore 大客户经理 |
| 15:15-15:50 | 基于纳米孔的直接RNA测序（DRS）实战 | 席飞虎 福建农林大学 |
| 15:50-15:55 | 在线答疑 | 席飞虎 福建农林大学 |
| 15:55-16:15 | Isoform定量转录组和RNA直接测序 | 陈虎 武汉贝纳科技有限公司 副总经理 |
| 16:15-16:20 | 在线问答与结束致辞 | 陈虎 武汉贝纳科技有限公司 副总经理 |
安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案，一天当作两天用
利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合，检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒，结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库，实现上述应用。
之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案，本期将要介绍的SureSelect XT HS2 RNA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性，靶向富集的RNA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化，样品起始量可低至10ng；试剂盒提供384对双端样本标签，接头序列中引入了分子标签，极大降低了测序中标签跳跃问题， 在去除Duplication时更准确；该试剂盒对整体建库流程进行了优化，建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 RNA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程，两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和RNA的平行建库。
RNAscope原位杂交技术对复杂组织进行空间表达分析
RNAscope和BaseScope原位杂交（ISH）广泛应用于人类样本库和临床科研以及临床前动物模型等组织中的高分辨率目标RNA表达分析。ACD的RNA-ISH检测在临床实验研究中是有效的，能够在复杂的组织微环境中进行定量的、细胞特异性的表达分析。
RNAscope和相关ISH技术的应用进展包括：
- 固定组织中RNA的单分子检测
- 空间、多重RNA-ISH用于RNAseq转录组学的验证
- SARS-CoV-2及其他病毒病原体检测
- 实体瘤组织中CAR-T细胞的检测
- AAV基因治疗的生物分布
RNAscope and BaseScope in situ hybridization (ISH) platforms are utilized worldwide for high resolution tissue-based target expression analysis in human archival and clinical biopsies, as well as in preclinical animal models. ACD’s RNA ISH assays are clinically validated and enable quantitative, cell-specific expression analysis within complex tissue microenvironments.
Advances in RNAscope and related ISH technologies will be discussed:
- Single-molecule detection of RNA in fixed tissues
- Spatial, multiplexed RNA ISH for validation of RNAseq transcriptomics
- SARS-CoV-2 and other viral pathogen assays
- CAR-T cell detection in solid tumor tissues
- AAV gene therapy biodistribution analysis
2018非编码RNA与转化医学网络研讨会第一期
近年来大量研究表明非编码RNA在人类疾病的调控中扮演了越来越重要的角色。包括肿瘤、神经系统疾病、心血管病的发生、以及参与免疫与代谢疾病调控、精子发育调控等，为开发疾病诊断标志物以及筛选新药靶标带来诸多新的方向。本次网络研讨会将围绕非编码RNA调控机理， 技术方法以及与疾病关系邀请名专家学者座谈，分享最新非编码RNA研究成果与经验，推动学科发展，促进转化医学及合作。