亚马逊参与新开发计算工具,助力COVID19研究
目前与冠状病毒感染相关的科学论文有1万多篇,最近几周来,防治COVID-19的研究正在加速,已经有4000多篇新的学术论文发表,涉及潜在的疫苗、疗法等多方面。要想快速推进这方面的研究,依靠人工处理这么大的信息量是低效的。对此,IRB巴塞罗那的结构生物信息学和网络生物学实验室在ICREA研究员Patrick Aloy的带领下,与亚马逊公司联合开发了一种计算工具
新发现!科学家鉴别出应对新型冠状病毒感染的免疫反应的潜在靶点!
2020年3月24日 讯 /生物谷BIOON/ --两个月内,一种此前并不为人所熟知的新型冠状病毒SARS-CoV-2在全球开始传播,感染了超过10万人(新闻发布时的数据),而且目前感染人数还在持续上升,有效的应对措施需要有用的工具来帮助监测病毒的传播,同时研究人员还需要了解机体免疫系统如何对病毒产生反应。近日,一项刊登在国际杂志Cell Host &
Nat Med:研究证实SARS-CoV-2属自然进化,不可能是人为制造!
2020年3月18日讯 /生物谷BIOON /——根据今天发表在《Nature Medicine》杂志上的研究结果,去年年底出现的新型SARS-CoV-2冠状病毒是自然进化的产物,自出现以来,它已经导致了大规模的COVID-19流行病,并蔓延到70多个其他国家。对来自SARS-CoV-2和相关病毒的公共基因组序列数据的分析发现,没有证据表明该病毒是在实验室制
研究人员开发基于植物功能性状的物种筛选模型
如何有效地进行生态恢复是当前生态学的一个重点研究方向,也是我国生态领域的重大需求之一。解决上述问题的关键是选取合适的恢复物种。传统研究中依靠人工经验和长时间的试种来完成此项工作,花费时间长,成功率低。基于具有相同恢复功能的物种在植物功能性状上存在一定相似性,科研人员开发了一个基于植物功能性状的物种筛选模型,并将其应用于实际植被恢复中。中国科学院华南植物园生态
Nature:血液中的微生物DNA可以预测癌症
2020年3月12日讯 /生物谷BIOON /——癌症微生物组的系统表征为开发利用非人类、微生物衍生的分子来诊断人类重大疾病的技术提供了机会。而最近的一些研究表明微生物在一些癌症中扮演着关键的作用。为此,来自加州大学圣地亚哥分校的Rob Knight带领他的研究小组重新审视了癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中未治疗过
Cell:震惊!研究发现肠道微生物代谢物会增加心血管疾病风险!
2020年3月10日讯 /生物谷BIOON /——克利夫兰诊所的研究人员已经确认了一种肠道微生物的副产品--苯乙酰谷氨酰胺(PAG)--与心血管疾病的发展有关,包括心脏病、中风和死亡。这项研究近日发表在《Cell》杂志上。苯丙氨酸是一种存在于许多食物中的氨基酸,包括以植物和动物为基础的蛋白质来源,如肉类、豆类和大豆。勒纳研究所心血管与代谢科学系主任、米勒家族
Nat Biotechnol:中外科学家联手开发出MEMOTE工具,可用于改善对全基因组范围代谢模型的质量控制
2020年3月8日讯/生物谷BIOON/---全基因组范围代谢模型(genome-scale metabolic model, GEM)的应用领域非常广泛,从设计细胞工厂和研究癌症代谢到分析微生物如何在我们的肠道内相互作用。因此,手动和自动生成的全基因组范围代谢模型的出版物数量每年都在增长。这可以被看作是一件积极的事情,但是很多数据对于其他人来说很难在不同的
bioRxiv:特殊模型有望帮助预测新型冠状病毒的潜在药物靶点
2020年3月7日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在预印版平台bioRxiv上题为“Predictions for the binding domain and potential new drug targets of 2019-nCoV”的研究报告中,来自北京科技大学的研究人员通过研究成功预测了新型冠状病毒(2019-nCoV)的结合域和新
联合全世界闲置计算机来研究新冠病毒,斯坦福推出新项目
全世界闲置的计算机联合起来!日前,由斯坦福大学潘德实验室(Pande Lab)主持的Folding@home分布式计算项目,正式向全世界发出邀请,寻找志愿者利用家里闲置的计算机,帮助研究人员开发新型冠状病毒的治疗方法。Folding@home(简称FAH)成立于2000年10月1日,是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算
ACS Central Sci:华人科学家开发个性化的癌症疫苗
2020年3月5日讯 /生物谷BIOON /--治疗性癌症疫苗早在100年前就被开发出来了,到目前为止仍然没有什么效果。在取得具体成果之前,必须克服两大障碍。首先,由于肿瘤突变对每个患者都是独特的,所以必须非常精确地靶向癌细胞抗原,这是很难做到的。其次,需要一个安全的系统将疫苗送到正确的位置,并实现强大和特异性的免疫反应。近日EPFL工程学院Tang Li团