单细胞图谱如何‘活’起来?
单细胞图谱正在让精准医学从愿景走向现实。从精准诊断到靶向治疗,再到个体化医疗,这张不断完善的“细胞地图”,将引领我们走向一个更健康、更精准的医学新时代。
2024-12-22
Cell:构建出一种追踪斑马鱼发育的新型细胞图谱——Zebrahub
论文第一作者说,“Zebrahub为首次极高精度地研究细胞在极其复杂的发育过程中的行为提供了机会。像这样在同一资源中同时结合单个细胞的基因表达和细胞随时间变化的空间图谱是非常罕见的。”
2024-10-30
Nature:全肠道细胞图谱如何重塑我们对炎症性肠病的理解?
研究中的全肠道细胞图谱数据集现已公开,可通过Gut Cell Atlas网站获取。这些数据资源为进一步的基础研究和临床应用提供了重要参考。
2024-12-08
FASEB J:新研究成功构建出健康人体腘绳肌腱的细胞图谱
在这项新的研究中,这些作者利用单核和空间转录组学技术,对健康腘绳肌腱中存在的不同细胞类型进行了分析。他们分析了来自四名健康人体捐献者的一万多个细胞核,发现了令人惊讶的多种细胞类型。
2024-07-02
Cell:首个大规模图谱显示基因突变对蛋白在细胞中最终位置的影响
在这项研究中,作者使用了功能强大的显微镜,并通过计算分析填补了视觉分析中的空白,将突变蛋白与正常蛋白的细胞旅程进行了比较。
2024-10-31
Nature:迄今为止最全面的人类肠道细胞图谱诞生!揭示肠道化生细胞在胃肠道疾病中的新作用
在这项新的研究中,作者开发了一种新工具来统一这些数据,从而创建了一个可供全球科学家们使用的标准化肠道细胞资源。这一工具也可应用于其他器官,并有助于促进进一步的研究。
2024-11-30
Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
2024-09-27
Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱
该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。
2024-08-27