研究发现大规模代谢物结构鉴定新算法MetDNA
近日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）杂志发表了由中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组的最新研究成果“Metabolic Reaction Network-based Recursive Metabolite Annotation for Untargeted Metabolomics”。基于液相色谱-质谱联用（LC-MS）技
一种新型多基因算法可预测一个人的肥胖风险
2019年4月22日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国麻省总医院和布罗德研究所的研究人员开发出一种新的工具，它可根据基因组中200多万个位点的基因变异来评估一个人变胖的风险。相关研究结果发表在2019年4月18日的Cell期刊上，论文标题为“Polygenic Prediction of Weight and Obesity Trajectories from Birth to
《Nature Methods》：研究提出一种新型的冷冻电镜三维重构算法
近期，清华大学生命科学学院李雪明研究组，电子工程系沈渊研究组和计算机系杨广文研究组三方合作在《自然 方法》（Nature Methods）杂志在线发表题为《一种基于粒子滤波的鲁棒的冷冻电镜三维重构算法框架》（A particle-filter framework for robust cryoEM 3D reconstruction）的研究论文。该工作通过将电子工程应用中的粒子滤波算法引入到冷冻电
研究开发新的表观遗传通路统计算法
11月30日，国际学术期刊Nature Methods 发表了中国科学院上海营养与健康研究院计算生物学研究所Andrew Teschendorff组的研究论文“Identification of differentially methylated cell types in epigenome-wide association studies”，报道了一种新的有助于识别与疾病相关的表观遗传通路的“
利用机器学习算法准确地预测细胞如何修复CRISPR诱发的DNA断裂
2018年11月9日/生物谷BIOON/---当双螺旋DNA因损伤（比如X射线暴露）发生断裂时，细胞中的分子机器会开展基因“自动校正（auto-correction）”，从而将基因组重新连接在一起，但是这种修复通常是不完美的。细胞中的天然DNA修复过程能够以一种看似随机且不可预测的方式在断裂位点处添加或移除DNA片段。利用CRISPR-Cas9编辑基因能够在特定位点上让DNA发生断裂，但是这可能会
新型AI算法如何探秘药物晶体结构？
近日，来自瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）的科学家们建立了一个名为ShiftML的机器学习程序，用来预测分子中的原子在磁场中的移动状况。这项研究发表在了《Nature Communications》上，表明AI可以帮助化学家们用比传统建模方法更快的方式，来破解晶体的分子结构。如今的许多药物都是以粉末状固体的形式生产出来的。但是，要想充分了解药物中的活性成分进入体
《人工智能深度学习算法评估规范》团体标准发布
7月1日，中国首个人工智能深度学习算法标准《人工智能深度学习算法评估规范》(Artificial intelligence—Assessment specification for deep learning algorithms)在“中国人工智能开源软件发展联盟”成立大会上正式发布。该标准由中国电子技术标准化研究院作为召集单位，中国科学院软件研究所作为技术牵头单位，联合上
PNAS：利用算法估测细胞间交流的方式，进一步探究生物钟的运行规律
2018年8月29日 讯 /生物谷BIOON/ --如果你曾经历过时差，那么您就熟悉昼夜节律，它可以控制新陈代谢的各个方面，从睡眠-觉醒周期到体温再到消化。身体中的每个细胞都有生物钟，但研究人员并不清楚细胞网络如何随时间相互交流，以及这些时序性的交流方式如何影响网络功能。在8月27日在《PNAS》杂志上发表的研究中华盛顿大学圣路易斯分校的研究人员等人开发了一种统一的，数据驱动的计算方法，用于推断和
科学家如何利用算法加速癌症等人类疾病的研究？
本文中，小编整理了多篇研究报告，共同解读科学家们如何利用算法来加速诸如癌症等多种人类疾病的研究，与大家一起学习！【1】Oncogene：科学家发现膀胱癌新靶点doi：10.1038/s41388-018-0367-0膀胱癌是美国第六常见的癌症，根据美国癌症学会（ACS）的统计，2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌，将近17000人死于这种疾病。在过去几年中，逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱
基因组算法立功！发现膀胱癌新靶点
膀胱癌是美国第六常见的癌症，根据美国癌症学会（ACS）的统计，2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌，将近17000人死于这种疾病。在过去几年中，逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌（p53-like bladder cancer）的基因表达模式与侵袭性的肌肉浸润性疾病相关，但人们尚不清楚该亚型对患者预后有何影响。现在，纽约西奈