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RNA+DNA同时测序 可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变

 当前的研究表明,诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生,并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个癌基因,是大规模探测突变的强有力工具,但在融合/重排检测方面仍具有一定挑战。靶向二代测序是一种能够综合鉴定癌症生物标志的方法,根据不同的变化情况,起始的检测材料可为DNA或

2020-11-20

安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用

利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。

2020-11-23

Nucleic Acids Res:冠状病毒RNA结构预测潜在药物靶点

近日,格罗宁根大学,华沙国际分子与细胞生物学研究所和莱顿大学的研究人员详细研究了SARS-CoV-2冠状病毒RNA基因组结构。 RNA结构是开发抗病毒药物的潜在目标。结果于11月10日作为“突破性论文”发表在《Nuclear Acid Research》杂志上。

2020-11-12

EMBO J:被认为仅具有RNA修饰作用的特殊蛋白TruB1或拥有潜在的抗癌潜能

2020年11月11日 讯 /生物谷BIOON/ --癌症的发生和进展是一种非常复杂的过程,当机体中的细胞失控生长时就会诱发癌症,目前研究人员发现了很多不同的机制和通路会直接影响细胞的增殖,近日,一篇刊登在国际杂志The EMBO Journal上的研究报告中,来自东京医科牙科大学等机构的科学家们取得了一项意外发现,即此前被认为仅会影响RNA分子结构的酶类或

2020-11-11

Nature:科学家开发出一种新型核酶 或有望帮助研究RNA甲基化、结构和功能之间的相互作用

2020年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --酶类能够催化自身无法发生的生化反应,在自然界中,大部分的蛋白质都能发挥酶类的作用,然而其它分子或许也能够发挥酶类反应,比如核糖核酸分子(RNAs分子),这些分子被称之为核酶;近日,一篇发表在国际杂志Nature上的研究报告中,来自维尔茨堡大学等机构的科学家们通过研究开发出了一种新型的核酶,其能在目标RNA的

2020-11-03

研究揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持机制

 近期,中国科学院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组以小鼠为模型,揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持的新机制。成体干细胞命运决定受到特殊微环境调控,在大多数组织中,微环境的形成和维持机制并不明确。精原干细胞是一类经典的成体干细胞,是哺乳动物精子发生的基础。精原干细胞自我更新和分化间的精准平衡依赖于体细胞信号,尤其是支持细胞分泌的

2020-10-20

Immunity:新技术可帮助修复单细胞RNA测序的丢失数据

从单个细胞中测序RNA可以揭示有关这些细胞在体内做什么的大量信息。麻省理工学院的研究人员现在通过修改常用的Seq-Well技术,大大提高了从每个细胞收集的信息量。

2020-10-15

Mol Cell:特殊小RNA分子在幽门螺杆菌感染人类的过程中扮演着关键角色

2020年10月22日 讯 /生物谷BIOON/ --全球有超过一半人机体的胃粘膜都携带有幽门螺杆菌,其在人的一生中通常并不会引发任何健康问题,但有时候幽门螺杆菌却会引发机体炎症发生,甚至会导致胃癌的发生。幽门螺杆菌能利用毒力因子来在携带者胃部存活并诱发疾病;日前,一篇刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自维尔茨堡大学等机构的科学家们

2020-10-22

Sci Rep:科学家成功利用人工RNA编辑技术修复基因组遗传代码 有望治疗多种遗传性疾病

2020年10月24日 讯 /生物谷BIOON/ --目前并没有确定的疗法来治疗由点突变引起的多种遗传性疾病,近日,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中,来自日本先进科学技术研究所等机构的科学家们通过利用人工的RNA编辑研究了一种治疗手段在治疗遗传性疾病上的可行性和有效性。尽管基因编辑技术作为一种基因修复技术备受关注,但诸如C

2020-10-24

研究揭示RNA m6A修饰调控人干细胞衰老的新机制

 N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物RNA上较为常见的一类转录后表观修饰,其建立、擦除和识别分别受到m6A甲基转移酶(writer)、去甲基化酶(eraser)以及结合蛋白(reader)的动态调控。已有研究表明,m6A作为基因表达调控中的重要节点,通过调节靶RNA的出核、稳定性、选择性剪接和翻译过程,参与调控诸多生物学事件,而关于m6A在衰老特

2020-10-14