纳米孔测序准确鉴定混合谱系(MLL)白血病复杂易位,识别差异性甲基化规律
急性白血病是一种骨髓癌症,特征是骨髓中由超过20%的白血病母细胞,治疗目标是达到完全缓解,有功能正常的骨髓,母细胞少于5%,而每位患者对治疗都会有不同的响应,并有可能存在具有临床显着性的微小残留病变(MRD),我们需要了解这些微小残留病变,因为它可能会导致复发,MRD监测是急性白血病和其它癌症中的一个快速新兴的领域。Tracy专注于混合谱系白血病
研究揭示玉米花药减数分裂期特异表达24-nt phasiRNA对甲基化的功能
PhasiRNA(phased, secondary, small interfering RNA)在植物的生长、发育、生殖以及抗病过程中发挥重要作用。在玉米花药发育过程中,有两类phasiRNA大量产生:一类是在细胞增殖分化期大量产生的21-nt phasiRNA,另一类是在减数分裂期大量富集的24-nt phasiRNA。已有研究发现,玉米多
研究阐述血液中细胞特异性的DNA甲基化改变
近期,中国科学院上海营养与健康研究所(中国科学院-马克斯·普朗克科学促进学会计算生物学伙伴研究所)研究员Andrew Teschendorff课题组与研究员汪思佳课题组合作,在Nature Communications上,在线发表题为A cell-type deconvolution meta-analysis of whole blood EW
纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论
大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa
Nature:科学家开发出一种新型核酶 或有望帮助研究RNA甲基化、结构和功能之间的相互作用
2020年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --酶类能够催化自身无法发生的生化反应,在自然界中,大部分的蛋白质都能发挥酶类的作用,然而其它分子或许也能够发挥酶类反应,比如核糖核酸分子(RNAs分子),这些分子被称之为核酶;近日,一篇发表在国际杂志Nature上的研究报告中,来自维尔茨堡大学等机构的科学家们通过研究开发出了一种新型的核酶,其能在目标RNA的
研究揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持机制
近期,中国科学院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组以小鼠为模型,揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持的新机制。成体干细胞命运决定受到特殊微环境调控,在大多数组织中,微环境的形成和维持机制并不明确。精原干细胞是一类经典的成体干细胞,是哺乳动物精子发生的基础。精原干细胞自我更新和分化间的精准平衡依赖于体细胞信号,尤其是支持细胞分泌的
研究揭示DNA去甲基化与阿尔茨海默病病变之间的关联
阿尔茨海默病(Alzheimer Disease,AD)是一种与衰老密切相关而复杂的多因素疾病,其发病机理较复杂。AD主要的神经病理特征为β-淀粉样蛋白沉积形成斑块和微管蛋白tau过度磷酸化形成神经纤维缠结。学界研究之前的AD病人脑组织样本和模型小鼠,发现在AD神经元退行性病变过程中存在明显的表观调控改变和功能失调,包括DNA甲基化和去甲基化。作
DNA甲基化参与调控大豆与大豆胞囊线虫互作的表观遗传研究取得进展
大豆胞囊线虫(Soybean cyst nematode, SCN; Heteroderaglycines)病是引起大豆减产的病害之一,研究大豆-线虫互作机制对提出新的病害防控策略、培育抗胞囊线虫病的大豆新品种具有重要意义。DNA甲基化(DNA methlation)是一种表观遗传标记,在植物生长发育及响应各种生物或非生物胁迫过程中发挥调控作用。研究表明,胞
Genome Med:单细胞RNA测序技术或能揭示胰腺肿瘤中单个细胞的特性 有望帮助开发个体化胰腺癌疗法
2020年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自美国翻译基因组学研究院等机构的科学家们通过研究详细描述了组成胰腺癌微环境的单个细胞的特性,这或许有望帮助开发新型疗法来治疗这种侵袭性且难以治疗的癌症类型。图片来源:CC0 Public Domain文章中,研究人员利用一种名为单细胞
研究揭示成瘾行为形成的DNA甲基化调控机制
成瘾性药物强化操作行为反应是药物滥用与成瘾的特征之一,在这种操作式条件反射的获得过程中,环境/线索与药物奖赏效应之间建立起联系,是长期戒断后环境/线索会诱发复吸的重要原因。以往研究关注受体或蛋白激酶在成瘾行为形成中的作用,但无法解释该行为能长期维持的原因。DNA甲基化主要通过在基因启动子区域的胞嘧啶上添加甲基,阻碍转录因子的结合,从而长时程抑制基