北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表，并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数
研究人员开发长非编码RNA数据库LncBook
近日，由中国科学院北京基因组研究所开发的人类长非编码RNA（long non-coding RNA， lncRNA）数据库LncBook正式上线。该项研究成果以LncBook： a curated knowledgebase of human long non-coding RNAs 为题在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。近年来，有关lncRNA的
QB期刊 |RNA-seq数据计算方法大汇总
引言 分子生物学的中心法则自1958年由Francis Crick提出到今年正好60周年，它描述了“DNA制造RNA，RNA制造蛋白质”的遗传信息的标准流程 [1]。十年前，第二代RNA测序技术(RNA-seq)的诞生及其迅速发展使得研究者可以在对RNA序列没有任何先验信息的情况下高通量地对全转录组进行测序 [2]。现如今第二
Nature：发现最大白血病数据库 辅助治疗药物的最优选
历经多年研究，科学家们发布了一个庞大的数据集，详细描述了500多名患有急性髓细胞性白血病（Acute myeloid leukemia，AML）患者肿瘤细胞的分子组成。该数据集包括数百个个体患者的细胞如何在实验室中对一系列药物做出反应，为日后对于AML的研究进一步打下基础。10月17日，《Nature》杂志以“Functional genomic landscape of acute
Nature：推出小鼠细胞的开源数据库---Tabula Muris
2018年10月5日/生物谷BIOON/---来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心（Chan Zuckerberg Biohub），弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队组建了一个名为Tabula Muris的小鼠细胞信息的开源数据库（网址：https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/）。在他们发表在Nature期刊上的标题为“Single
升级版环形RNA数据库网站发布
近日，国际学术期刊Genomics， Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康院）中科院－德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2： An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati
两篇Nature论文聚焦英国生物样本库中的基因组和表型数据
2018年10月13日/生物谷BIOON/---两个研究团队独立地在Nature期刊上发表两篇论文，描述了使用英国生物样本库（UK Biobank）中的全套数据开展的研究。第一个研究团队由来自英国、澳大利亚和瑞士的研究人员组成---他们搜索了英国生物样本库，从中寻找遗传变异和表型之间的关联性，以便填补这些数据中的空白。第二个研究团队由牛津大学的研究人员组成---他们使用英国生物样本库旨在将遗传数据
科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库！
2018年1月5日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中，来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本，开发出了集合血液代谢物的数据库，目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。图片来源：www.thoughtco.com代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程，同时还能阐明细胞和其周围环境之间的相互
中国科学家构建首个创伤后应激障碍遗传学数据库
创伤后应激障碍(Posttraumatic stress disorder，PTSD)发生在创伤事件暴露后，是具有复杂病因的综合征。美国2013年公布的第五版《精神障碍诊断与统计手册》中，PTSD已从“焦虑障碍”组移到新的分组“创伤和应激相关障碍”中。经历创伤事件是罹患PTSD的必要条件之一，关于全球创伤事件暴露的流行病学研究表明，70%的受访者至少报告了一例创伤事件，但其中只有少数人
中国科学家发布表观基因组数据库MethBank 3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0： a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Research上。Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。作为表观修饰的重要组成部分，DNA甲基化