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Cell:利用Perturb-seq技术大规模探究与关键发育基因相关的脑细胞类型

研究人员发明了一种名为体内Perturb-seq的新技术。这种方法利用CRISPR-Cas9技术和单细胞转录组分析,一次一个细胞地测量对细胞的影响。

2024-05-27

Cell:利用Perturb-FISH研究基因和遗传回路在组织发育、稳态和功能障碍中的作用

Farhi及其团队旨在开发一种综合方法,可以立即测量细胞中哪些基因发生了改变,哪些遗传扰动导致了这些变化,以及受影响细胞相对于其他细胞的位置。

2025-04-03

Nature Methods:Paired-Damage-seq —— 同步解析DNA损伤与基因表达

这项研究为我们揭示了细胞基因组的“脆弱点”,也为我们理解生命体的基本运作规律和疾病的发生机制打开了新的窗口。

2025-04-03

Nature Methods:Paired-Damage-seq——同步解析DNA损伤与基因表达

研究人员开发了一种名为Paired-Damage-seq的全新技术,能够以前所未有的精度在单个细胞水平上同时分析氧化损伤和单链DNA损伤,并结合分析基因的表达情况。

2025-03-29

NIS-Seq开启基因筛选新纪元

研究人员开发了一种创新技术——核内原位测序,其显著特点在于通过在细胞核内生成亮度极高的测序信号,实现了细胞类型不可知的高密度光学筛选。

2024-12-22

Science:颠覆传统基因组结构变异研究,Genome-Shuffle-seq的高效生成与精确检测

这项技术通过集成一类名为“Shuffle cassette”的基因组构件,将多个SV诱导事件以高通量的方式集成到细胞群体中,并能利用特定的条形码系统,在不同的细胞内追踪这些变异的发生与影响。

2025-02-05

Science:生命起点的高清导航——scNanoATAC-seq2为理解哺乳动物早期发育提供关键表观遗传路标

该研究揭示了早期胚胎发育过程中表观遗传调控的诸多新机制和新规律,让我们对生命如何从一个简单的蓝图(DNA)一步步构建成复杂的个体,有了更深刻的理解。

2025-04-05

Cell:新研究指出人类scRNA-seq 数据集存在隐私泄露风险,应加强保护

利用不同实验室生成的数据,甚至用不同方法处理的数据,然后用它来将完全不同的匿名数据集中的个体关联起来,这种能力相当惊人,而且凸显了单细胞数据的真正隐私问题。

2024-10-24

Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质可及性图谱

SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。

2024-07-16

Nature子刊:何川团队开发RNA结合蛋白靶点检测新方法——ARTR-seq

在这项研究中,何川团队为了克服现有方法的局限性,提出了一种基于逆转录酶(RT)的RBP结合位点测序方法——ARTR-seq,通过原位逆转录酶捕获RBP-RNA相互作用。

2024-01-11