Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Front Med:对DNA损伤修复基因进行表观遗传学沉默或能揭示一种胰腺癌疗法的潜在标志物
研究结果表明,AZD0156的表观遗传化沉默或能作为预测胰腺癌治疗中患者对ATM抑制剂产生反应的特殊生物标志物。
2024-11-23
Cancer Cell:中山大学孙颖团队等实现利用血浆EB病毒DNA实时监测鼻咽癌疗效和预后
研究共前瞻性收集了1000例接受根治性放化疗的鼻咽癌患者治疗过程中12个时间点的外周血(图1),首次完整地绘制了诱导化疗以及放疗过程中cfEBV DNA的动态变化图谱。
2024-08-01
PNAS丨谭蔚泓、韩达合作解密sgc8c DNA适体的复杂三维结构和功能优化
研究结果揭示了sgc8c DNA适体形成精密复杂的三通结构,它能巧妙地从不同区域招募十余个核苷酸汇聚于三通中心构成其“结构-功能”的关键位点,这些信息有效地指导了适体的功能优化。
2024-07-28
Nature:癌症或是由不可逆的DNA突变与表观遗传改变引起
本文研究结果表明,在没有驱动突变存在的情况下,Polycomb蛋白的不可逆剔除会诱导癌症发生,这或许就表明,肿瘤会通过表观遗传学失调而出现,从而引起了所改变的细胞命运的遗传。
2024-06-07
Cell:揭示Mrc1蛋白能够在DNA复制的滞后链和前导链之间移动组蛋白
最新的研究发现,复制叉保护复合物(FPC)不仅参与DNA复制,还能促进带有特定表观遗传标记的亲代组蛋白被再利用到新的DNA链上,这对于维持表观遗传记忆非常重要。
2024-08-28
Nat Commun:特殊的DNA标志物或能揭示罕见的人类致死性自身免疫性疾病的发病机制
这项研究中,研究人员分析了大约1400名系统性硬化症日本个体的遗传数据,以及超过11.2万名未患这种疾病的日本个体的数据。
2024-06-23
Cell子刊:湖北大学李壮团队解析I型CRISPR-Cas系统中HNH介导的靶DNA切割机制
该研究通过系统的结构和生化研究,阐明融合了HNH核酸酶结构域的I型CRISPR-Cas变体系统的工作机理,为进一步的基因编辑应用和优化开发做了铺垫。
2024-08-03
哈佛团队发现,DNA甲基化是连接童年逆境与抑郁症的桥梁
基于人体血液的表观基因组DNA甲基化数据、童年经历和抑郁状态等数据,找到了70个胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸(CpGs)位点,并发现它们可以解释逆境与抑郁症状之间10-73%的相关性。
2024-12-09